RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-215	ENST00000557654	RAF1	P04049	648 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	VPREB1	P12018	145 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CA4	P22748	312 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	TAF6	P49848	677 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	SNX16	P57768	344 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CBX1	P83916	185 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CDR2	Q01850	454 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654		Q6ZSR9	355 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ABCC4	O15439	1325 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	IFT172	Q9UG01	1749 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	OR10H2	O60403	315 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	AVIL	O75366	819 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	REC8	O95072	547 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	EDN1	P05305	212 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CSH1	P0DML2	217 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CSH2	P0DML3	217 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ARSE	P51690	589 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	SIRPA	P78324	504 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CDK3	Q00526	305 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	MEA1	Q16626	185 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ABCC1	P33527	1531 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ADGRB1	O14514	1584 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654		A0A087WW49	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	SH3BP5	O60239	455 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ENTPD3	O75355	529 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CRLF1	O75462	422 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	AP2A2	O94973	939 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ADCY5	O95622	1261 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	DNASE1	P24855	282 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	BMX	P51813	675 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	PPARD	Q03181	441 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	PCLAF	Q15004	111 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	PLCH2	O75038	1416 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	SSH2	Q76I76	1423 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GPHN-215	ENST00000557654	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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