RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 NIPSNAP2O75323 286 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 RASSF9O75901 435 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 HAUS5O94927 633 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 APOA4P06727 396 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CHRM3P20309 590 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 OGNP20774 298 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 AOAHP28039 575 aa9.34□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CRYMQ14894 314 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 TRADDQ15628 312 aa9.34□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.34□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.34□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 LCN9Q8WX39 176 aa9.34□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 C9orf72Q96LT7 481 aa9.34□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.34□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 FBXO5Q9UKT4 447 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 CDYLQ9Y232 598 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-217ENST00000550044 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
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CS-217ENST00000550044 OR5K3A6NET4 321 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 BTN3A3O00478 584 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 HGSO14964 777 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 GPC4O75487 556 aa9.33□□□□□ -0.92
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CS-217ENST00000550044 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
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CS-217ENST00000550044 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
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CS-217ENST00000550044 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 DUPD1Q68J44 220 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.33□□□□□ -0.92
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CS-217ENST00000550044 UNC5AQ6ZN44 842 aa9.33□□□□□ -0.92
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CS-217ENST00000550044 DTX1Q86Y01 620 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 SLC22A15Q8IZD6 547 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 BBOF1Q8ND07 529 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.33□□□□□ -0.92
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CS-217ENST00000550044 RNF31Q96EP0 1072 aa9.33□□□□□ -0.92
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CS-217ENST00000550044 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
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CS-217ENST00000550044 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-217ENST00000550044 SLC39A1Q9NY26 324 aa9.33□□□□□ -0.92
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