RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492170.1

MRPL55-231, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 5

Gene MRPL55, Length 241 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-231	ENST00000492170	NACC2	Q96BF6	587 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	IL17F	Q96PD4	163 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PANX3	Q96QZ0	392 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	MENT	Q9BUN1	341 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	AGPS	O00116	658 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SLCO2B1	O94956	709 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	FKBP9	O95302	570 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	DDAH2	O95865	285 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ALB	P02768	609 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	MMP11	P24347	488 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	AOAH	P28039	575 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	GCGR	P47871	477 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SOX8	P57073	446 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	FOXL2	P58012	376 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SNX1	Q13596	522 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	GRM7	Q14831	915 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	TCTE1	Q5JU00	501 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	KRT222	Q8N1A0	295 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PRR7	Q8TB68	274 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	WDR54	Q9H977	334 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CUTC	Q9NTM9	273 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CDC23	Q9UJX2	597 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	DSCR3	O14972	297 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	KPNA5	O15131	536 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ETS1	P14921	441 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ITGA3	P26006	1051 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	GRB7	Q14451	532 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	NR6A1	Q15406	480 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PCID2	Q5JVF3	399 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	LRRC6	Q86X45	466 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	MPP5	Q8N3R9	675 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	C19orf60	Q96EN9	201 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL55-231	ENST00000492170	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	MASP2	O00187	686 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	NDUFS3	O75489	264 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ONECUT2	O95948	504 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	RNF224	P0DH78	156 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ITGAX	P20702	1163 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	GRIA3	P42263	894 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	FCRL6	Q6DN72	434 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	VPS50	Q96JG6	964 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	FOPNL	Q96NB1	174 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	IL22	Q9GZX6	179 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170		A1L4Q6	167 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	TARM1	B6A8C7	271 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	AP3B1	O00203	1094 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	MCM3	P25205	808 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	BDKRB1	P46663	353 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	NKG7	Q16617	165 aa		14.69	□□□□□ -0.06

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