RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 IPPKQ9H8X2 491 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 PARVBQ9HBI1 364 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 SPAG4Q9NPE6 437 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 FZD3Q9NPG1 666 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 A0A1W2PQU0 124 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 SLC5A10A0PJK1 596 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 QSOX1O00391 747 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 OR7A17O14581 309 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 H6PDO95479 791 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 MLYCDO95822 493 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 ANXA5P08758 320 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 MPC1LP0DKB6 136 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 ERVPABLB-1P60509 514 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 MTX3Q5HYI7 312 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 KANK2Q63ZY3 851 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 REP15Q6BDI9 236 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 LETMD1Q6P1Q0 360 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 HLA-CQ95604 372 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 TMIGD2Q96BF3 282 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 PYCR2Q96C36 320 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 C19orf60Q96EN9 201 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 MRGPRX1Q96LB2 322 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 PHF12Q96QT6 1004 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 CD244Q9BZW8 370 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 RDH14Q9HBH5 336 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 GFYI3L273 518 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 ESRRBO95718 433 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 ALDH3B2P48448 385 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 ADPRHP54922 357 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 CDK3Q00526 305 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 GTF2H3Q13889 308 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 IRF4Q15306 451 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 SNX31Q8N9S9 440 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 HMGCLL1Q8TB92 370 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 SLCO4A1Q96BD0 722 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 EFHD1Q9BUP0 239 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 MYRFQ9Y2G1 1151 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 COL6A3P12111 3177 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 H3BNH8 94 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 GIPC1O14908 333 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 POP7O75817 140 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 STAMBPO95630 424 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 C8GP07360 202 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 HIST1H2ADP20671 130 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 CDK9P50750 372 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 TFF2Q03403 129 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 SGCGQ13326 291 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 NFE2L1Q14494 772 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 KRT80Q6KB66 452 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 Q6ZS52 159 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 COX14Q96I36 57 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 HBEGFQ99075 208 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 SLC29A1Q99808 456 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 HIST1H2AJQ99878 128 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 H2AFJQ9BTM1 129 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 SLC25A23Q9BV35 468 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 ATG10Q9H0Y0 220 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 TM7SF3Q9NS93 570 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 OPTCQ9UBM4 332 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
PRRT4-205ENST00000489835 FBP2O00757 339 aa16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 SLC31A1O15431 190 aa16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 IL9P15248 144 aa16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 NDUFV2P19404 249 aa16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 BDKRB1P46663 353 aa16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 RPS21P63220 83 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 CCINQ13939 588 aa16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 LPCAT2Q7L5N7 544 aa16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 OR4F6Q8NGB9 312 aa16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 CIB1Q99828 191 aa16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 PNPLA3Q9NST1 481 aa16.83■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa16.82■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGEF33A8MVX0 844 aa16.82■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 MATN4O95460 622 aa16.82■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 ACADMP11310 421 aa16.82■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 SLC7A1P30825 629 aa16.82■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 PIK3CGP48736 1102 aa16.82■□□□□ 0.28
PRRT4-205ENST00000489835 PPP2CBP62714 309 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms