RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 IL36AQ9UHA7 158 aa26.89■■□□□ 1.9
CERS1-201ENST00000429504 ADGRE2Q9UHX3 823 aa26.89■■□□□ 1.9
CERS1-201ENST00000429504 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa26.89■■□□□ 1.9
CERS1-201ENST00000429504 WNT6Q9Y6F9 365 aa26.89■■□□□ 1.9
CERS1-201ENST00000429504 CEPT1Q9Y6K0 416 aa26.89■■□□□ 1.9
CERS1-201ENST00000429504 PRAMEF4O60810 478 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 JUPP14923 745 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 SDC1P18827 310 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 VASPP50552 380 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 PFN3P60673 137 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 SLC44A4Q53GD3 710 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 USP51Q70EK9 711 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 FKBP9P1Q75LS8 142 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 DPPA4Q7L190 304 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 FBXL20Q96IG2 436 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 LRIG1Q96JA1 1093 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 HHIPQ96QV1 700 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 MYO7AQ13402 2215 aa26.89■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 A0A087WXM4 84 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 FADS2P1A8MWK0 482 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 FAM220BPB1ANY3 271 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 H0YAE9 185 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 CTSLP07711 333 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 ITPKAP23677 461 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 ZNF805Q5CZA5 627 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 CALHM3Q86XJ0 350 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 MICU2Q8IYU8 434 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 NAT16Q8N8M0 369 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 HCAR2Q8TDS4 363 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 VPS35Q96QK1 796 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 CXCR6O00574 342 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 SNAP29O95721 258 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 RETP07949 1114 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 ARSFP54793 590 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 CHIT1Q13231 466 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 ZNF284Q2VY69 593 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 GTDC1Q4AE62 458 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 PRSS36Q5K4E3 855 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 LDLRAP1Q5SW96 308 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 LIPJQ5W064 366 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 TBPL2Q6SJ96 375 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 CYP2U1Q7Z449 544 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 NECAB2Q7Z6G3 386 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 BTN2A2Q8WVV5 523 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 TMBIM1Q969X1 311 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 FCRL1Q96LA6 429 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 TSSK3Q96PN8 268 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 SH3GL3Q99963 347 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 SLC6A13Q9NSD5 602 aa26.88■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 C16orf96A6NNT2 1141 aa26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 AMD1P17707 334 aa26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 HALP42357 657 aa26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 ALDH3A2P51648 485 aa26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 FAM86B1Q8N7N1 296 aa26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 APIPQ96GX9 242 aa26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 ATG10Q9H0Y0 220 aa26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 LIMD1Q9UGP4 676 aa26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa26.87■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 OR2AG2A6NM03 316 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 SYN1P17600 705 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 XPAP23025 273 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 TACR1P25103 407 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 PTPN6P29350 595 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 MTHFRP42898 656 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 ENPP6Q6UWR7 440 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 GCNT7Q6ZNI0 430 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 GPR149Q86SP6 731 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 FBXO10Q9UK96 956 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 PPT2Q9UMR5 302 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 KRT87PA6NCN2 255 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 CTNNB1P35222 781 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 DAG1Q14118 895 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 FBXO30Q8TB52 745 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 GLMNQ92990 594 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 FAM162AQ96A26 154 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 MPP4Q96JB8 637 aa26.86■■□□□ 1.89
CERS1-201ENST00000429504 ZSWIM3Q96MP5 696 aa26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms