RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 E7EQ34 232 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 H0Y8X5 98 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 LATO43561 262 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 KRT36O76013 467 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 ACP5P13686 325 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 DGKEP52429 567 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 HMGCS1Q01581 520 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 EMX2Q04743 252 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 GRIK2Q13002 908 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 CHIT1Q13231 466 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 E2F2Q14209 437 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 RCN1Q15293 331 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 UBALD2Q8IYN6 164 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 DSELQ8IZU8 1212 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 FNDC5Q8NAU1 212 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 KYQ8NBH2 561 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 SGPP1Q9BX95 441 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 FOXQ1Q9C009 403 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 SGK2Q9HBY8 427 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 FGF22Q9HCT0 170 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 STOML1Q9UBI4 398 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.33■□□□□ 0.85
GPC1-202ENST00000420138 LRRC72A6NJI9 287 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 FAM170BA6NMN3 283 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 E7ENX8 843 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 UGDHO60701 494 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 PDYNP01213 254 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 JUPP14923 745 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 KIAA1024LP59773 190 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 ACTR3P61158 418 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 TBPL1P62380 186 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 TAP2Q03519 686 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 NR6A1Q15406 480 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 MAPRE2Q15555 327 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 CCDC6Q16204 474 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 SGO1Q5FBB7 561 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 NELL2Q99435 816 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 ACPTQ9BZG2 426 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 EFCAB1Q9HAE3 211 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 SLC28A1O00337 649 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 KRT6AP02538 564 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 KRT6BP04259 564 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 GCKP35557 465 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 HALP42357 657 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 KRT6CP48668 564 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 NEK2P51955 445 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 LRP8Q14114 963 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 LIPJQ5W064 366 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 HOMEZQ8IX15 550 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 MENTQ9BUN1 341 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.32■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 C9JVG2 144 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 RGS14O43566 566 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 SEMA4FO95754 770 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 NPPBP16860 134 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 DPP6P42658 865 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 CLCNKAP51800 687 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 IRF8Q02556 426 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 STX5Q13190 355 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 DOC2AQ14183 400 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 REP15Q6BDI9 236 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 IL17FQ96PD4 163 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 NRTNQ99748 197 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 ACTL8Q9H568 366 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 SNX6Q9UNH7 406 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 KCNK6Q9Y257 313 aa20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 SERTM1A2A2V5 107 aa20.3■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 FPGTO14772 594 aa20.3■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 IGHV4-34P06331 123 aa20.3■□□□□ 0.84
GPC1-202ENST00000420138 ERGP11308 486 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms