RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ITPKCQ96DU7 683 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 C1orf50Q9BV19 199 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC32A1Q9H598 525 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SELENONQ9NZV5 590 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CLEC1BQ9P126 229 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ST14Q9Y5Y6 855 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CKAP5Q14008 2032 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 GFYI3L273 518 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 FFAR3O14843 346 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 GPR42O15529 346 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SLCO2B1O94956 709 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 MATN4O95460 622 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SOD1P00441 154 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 DPP6P42658 865 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SOX9P48436 509 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 HNMTP50135 292 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 AP1S2P56377 157 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PSME3P61289 254 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 AP2B1P63010 937 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC34A1Q06495 639 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CNTN1Q12860 1018 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 NR6A1Q15406 480 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 IGSF11Q5DX21 431 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PIGGQ5H8A4 983 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 Q6ZSR9 355 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 KRT77Q7Z794 578 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SPARTQ8N0X7 666 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF148Q8N7C7 305 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 HIPK4Q8NE63 616 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 JADE3Q92613 823 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 NTMT1Q9BV86 223 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 HDAC8Q9BY41 377 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 S1PR5Q9H228 398 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 AIG1Q9NVV5 245 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ADA2Q9NZK5 511 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ACAD8Q9UKU7 415 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 C9JVG2 144 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ANGPT2O15123 496 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CBFA2T3O75081 653 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 FKBP6O75344 327 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 TSPAN9O75954 239 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 WDR47O94967 919 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 GSTM1P09488 218 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 EBLN1P0CF75 366 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 RCVRNP35243 200 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 GGT5P36269 586 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PREPP48147 710 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CCNIQ14094 377 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ABRAXAS2Q15018 415 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ADRM1Q16186 407 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CDONQ4KMG0 1287 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 TTC23LQ6PF05 361 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 LAYNQ6UX15 382 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SFRP1Q8N474 314 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC26A7Q8TE54 656 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB7BQ96AH8 199 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 OR2AG1Q9H205 316 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ACTR8Q9H981 624 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CLDND1Q9NY35 253 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 KLQ9UEF7 1012 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 KRT87PA6NCN2 255 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC85CA6NKD9 419 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM4-202ENST00000409093 CLDN9O95484 217 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms