RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 GMPRP36959 345 aa16.83■□□□□ 0.28
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SH3BP4-202ENST00000392011 FAM91A1Q658Y4 838 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 PIGXQ8TBF5 258 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 DIRAS2Q96HU8 199 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 COL21A1Q96P44 957 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 MTRRQ9UBK8 725 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 MYH11P35749 1972 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 TIE1P35590 1138 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 AGTR2P50052 363 aa16.83■□□□□ 0.28
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SH3BP4-202ENST00000392011 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PP18 115 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 CDH1P12830 882 aa16.83■□□□□ 0.28
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SH3BP4-202ENST00000392011 FMO3P31513 532 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 GPM6BQ13491 265 aa16.83■□□□□ 0.28
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SH3BP4-202ENST00000392011 PLET1Q6UQ28 207 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 RPTNQ6XPR3 784 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF778Q96MU6 729 aa16.83■□□□□ 0.28
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SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF222Q9UK12 451 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 FZD4Q9ULV1 537 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF11Q9Y3C5 154 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 KRT33AO76009 404 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 KLK1P06870 262 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 ADH5P11766 374 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 CCT3P49368 545 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 LAPTM4BQ86VI4 370 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAJB8Q8NHS0 232 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM40Q8WWA1 233 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 B4GALT6Q9UBX8 382 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 MMP20O60882 483 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 PGLSO95336 258 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 BDKRB1P46663 353 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 DSC3Q14574 896 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 OAFQ86UD1 273 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 IGSF8Q969P0 613 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 GAL3ST4Q96RP7 486 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 STON1Q9Y6Q2 735 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 COCHO43405 550 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 LDB2O43679 373 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 STATHP02808 62 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 PGRP06401 933 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 PRKAR1AP10644 381 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 DIO3P55073 304 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 IL18R1Q13478 541 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 GPRC6AQ5T6X5 926 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 TMBIM1Q969X1 311 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 CCM2Q9BSQ5 444 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf21Q9H246 121 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM53CQ9NYF3 392 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 CALML5Q9NZT1 146 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 DCLK1O15075 740 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 OR1I1O60431 355 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 KLHL18O94889 574 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 GBAP04062 536 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 IVDP26440 423 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP16.82■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 13.5
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SH3BP4-202ENST00000392011 USP30Q70CQ3 517 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 PEX5LQ8IYB4 626 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM145Q8NBT3 493 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 TRPV3Q8NET8 790 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP295NLQ96MC4 621 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC35A5Q9BS91 424 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 OR51V1Q9H2C8 321 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2QL1A1L167 161 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 RIIAD1A6NNX1 92 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC30A4O14863 429 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR32O75388 356 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 GDI1P31150 447 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 RHDQ02161 417 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 SCARB2Q14108 478 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 TEAD2Q15562 447 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF678Q5SXM1 525 aa16.81■□□□□ 0.28
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