RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-210ENST00000588340 KCND3Q9UK17 655 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-210ENST00000588340 CROTQ9UKG9 612 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-210ENST00000588340 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-210ENST00000588340 PADI1Q9ULC6 663 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-210ENST00000588340 BTRCQ9Y297 605 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-210ENST00000588340 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-210ENST00000588340 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-210ENST00000588340 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-210ENST00000588340 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-210ENST00000588340 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-210ENST00000588340 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ESYT3A0FGR9 886 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM159BA6NKW6 160 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 H3BMM5 538 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 MATN2O00339 956 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 BTN3A3O00478 584 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 BTN3A1O00481 513 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SUV39H1O43463 412 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC28A2O43868 658 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 KATNA1O75449 491 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 MATN4O95460 622 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TSPAN12O95859 305 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FTH1P02794 183 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 NTRK1P04629 796 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TPBGLP0DKB5 382 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ERGP11308 486 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 CDH3P22223 829 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 CLCN7P51798 805 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 NFKB2Q00653 900 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 CALCOCO2Q13137 446 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 PRKG2Q13237 762 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNAB2Q13303 367 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 DNASE1L3Q13609 305 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 CUL1Q13616 776 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ERV3-1Q14264 604 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 GRB7Q14451 532 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 LAPTM4AQ15012 233 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 BRD3Q15059 726 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR19Q15760 415 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 BBS9Q3SYG4 887 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNMB4Q86W47 210 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 OR8K5Q8NH50 307 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 CALML6Q8TD86 181 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ELMO1Q92556 727 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TTC1Q99614 292 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 NRTNQ99748 197 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 DPH5Q9H2P9 285 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 LHX9Q9NQ69 397 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 POMT2Q9UKY4 750 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TENM4Q6N022 2769 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 PIPSLA2A3N6 862 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 GSAPA4D1B5 854 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 C2orf74A8MZ97 194 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 C21orf140B9A014 251 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 F8W8V4 182 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-210ENST00000588340 KPNA5O15131 536 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms