RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784		H3BMH7	237 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	MEN1	O00255	615 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	MATN4	O95460	622 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PLA2G2A	P14555	144 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CHRM3	P20309	590 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PTGIR	P43119	386 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	KCNAB2	Q13303	367 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ERV3-1	Q14264	604 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SYVN1	Q86TM6	617 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	GPR135	Q8IZ08	494 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CHST8	Q9H2A9	424 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	NFS1	Q9Y697	457 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784		E5RI56	91 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF749	O43361	778 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	TTC4	O95801	387 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PGAM1	P18669	254 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	IVD	P26440	423 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SLC1A2	P43004	574 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	BDKRB1	P46663	353 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CLCN7	P51798	805 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CTBP1	Q13363	440 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	UGT8	Q16880	541 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CNST	Q6PJW8	725 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	KCNJ9	Q92806	393 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	IL17F	Q96PD4	163 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	NAT9	Q9BTE0	207 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.27
PKD1-231	ENST00000566784	CDC14C	A4D256	554 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC188	H7C350	402 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	SMAP	O00193	183 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	HCRTR1	O43613	425 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	OR2B3	O76000	313 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	FURIN	P09958	794 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	MAG	P20916	626 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	CRYM	Q14894	314 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	KCNMB4	Q86W47	210 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	FAM136A	Q96C01	138 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PKD1-231	ENST00000566784	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		13.33	□□□□□ -0.28

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