RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GKN2Q86XP6 184 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DENND1CQ8IV53 801 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 KCT2Q8NC54 265 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AP1S3Q96PC3 154 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 YIPF1Q9Y548 306 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 F8VP50 259 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 WWP2O00308 870 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NRP1O14786 923 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ITM2AO43736 263 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GRAP2O75791 330 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ANGPTL1O95841 491 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 COX7A2P14406 83 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DGKAP23743 735 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PAX6P26367 422 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GCH1P30793 250 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CNR2P34972 360 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 KCNMA1Q12791 1236 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CADM2Q8N3J6 435 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SFRP1Q8N474 314 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NETO1Q8TDF5 533 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TSPEARQ8WU66 669 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RAB7BQ96AH8 199 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TEPSINQ96N21 525 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CACNA1FO60840 1977 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 A0A075B6Q4 140 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF98A6NK75 572 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C9J4A7 227 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LILRB3O75022 631 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR2B3O76000 313 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PGLSO95336 258 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ELFN1P0C7U0 828 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ADH5P11766 374 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NR2C1P13056 603 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CASRP41180 1078 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 POU4F1Q01851 419 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FGL1Q08830 312 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FOXC1Q12948 553 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MEA1Q16626 185 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TDRPQ86YL5 185 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR2L3Q8NG85 312 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ST8SIA2Q92186 375 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PGM2Q96G03 612 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf74Q96LT6 269 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM68Q96MH6 324 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF347Q96SE7 839 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEH1Q9H213 219 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HEY2Q9UBP5 337 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ESYT3A0FGR9 886 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CLPXO76031 633 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CSTAP01040 98 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MMP8P22894 467 aa6.18□□□□□ -1.42
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