RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 LGR4Q9BXB1 951 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM184CQ9NVA4 438 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 C9IYK1 514 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PIP5K1BO14986 540 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 CD63P08962 238 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 USP43Q70EL4 1123 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 FRG2BQ96QU4 278 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 OR6K2Q8NGY2 324 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PSMA8Q8TAA3 256 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 Q9N2J8 555 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 CDH7Q9ULB5 785 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 DLG5Q8TDM6 1919 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 PEX12O00623 359 aa8.32□□□□□ -1.08
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