RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
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CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa18.6■□□□□ 0.57
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CD27-AS1-208ENST00000538616 CD180Q99467 661 aa18.6■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 TSSK1BQ9BXA7 367 aa18.6■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 MFRPQ9BY79 579 aa18.6■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.6■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 GNPTGQ9UJJ9 305 aa18.6■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 POMT2Q9UKY4 750 aa18.6■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 CRYL1Q9Y2S2 319 aa18.6■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.6■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKUB1A6NFN9 424 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 PAMP19021 973 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDH3P22223 829 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARL4DP49703 201 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 TUBB3Q13509 450 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 TYSND1Q2T9J0 566 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 NEPROQ6NW34 567 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 CENPUQ71F23 418 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 TBC1D21Q8IYX1 336 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR5K2Q8NHB8 316 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 ASZ1Q8WWH4 475 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 BIRC8Q96P09 236 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 KLHL25Q9H0H3 589 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITPR3Q14573 2671 aa18.59■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 APCP25054 2843 aa18.58■□□□□ 0.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa18.58■□□□□ 0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 NIPSNAP2O75323 286 aa18.58■□□□□ 0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 TIAF1O95411 115 aa18.58■□□□□ 0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 APOA4P06727 396 aa18.58■□□□□ 0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 PVRP15151 417 aa18.58■□□□□ 0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 IVDP26440 423 aa18.58■□□□□ 0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSD11B2P80365 405 aa18.58■□□□□ 0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPR19Q15760 415 aa18.58■□□□□ 0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 IZUMO3Q5VZ72 239 aa18.58■□□□□ 0.56
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