RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	DEC1	Q9P2X7	70 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	MED16	Q9Y2X0	877 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	PSAT1	Q9Y617	370 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717		R4GN57	208 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	CACNA1H	O95180	2353 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	FRYL	O94915	3013 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1W2PQ67	120 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1W2PQF6	199 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	MYO1C	O00159	1063 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	AREL1	O15033	823 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC7A4	O43246	635 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	UGT1A9	O60656	530 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	ADAM23	O75077	832 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	AGR2	O95994	175 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	EGF	P01133	1207 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	MT-ND5	P03915	603 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	POLB	P06746	335 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	LHCGR	P22888	699 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	ITGB7	P26010	798 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	GABRB3	P28472	473 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	GK	P32189	559 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	FOXN2	P32314	431 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	HMGCL	P35914	325 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	MMP12	P39900	470 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	ETV4	P43268	484 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	ARFIP2	P53365	341 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	COPA	P53621	1224 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	KDSR	Q06136	332 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	RALGDS	Q12967	914 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	PEX6	Q13608	980 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	GALNT3	Q14435	633 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	POU6F1	Q14863	301 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	PTPRR	Q15256	657 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	MZT2A	Q6P582	158 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	TSSK4	Q6SA08	328 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717		Q6ZS52	159 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	CROCCP2	Q86T23	111 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF605	Q86T29	641 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	TRABD2A	Q86V40	505 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	CNPY4	Q8N129	248 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	TMIE	Q8NEW7	156 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	STYX	Q8WUJ0	223 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	SCRN2	Q96FV2	425 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	SMIM14	Q96QK8	99 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	CYTH2	Q99418	400 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	ACOX2	Q99424	681 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	PAFAH2	Q99487	392 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	TRABD	Q9H4I3	376 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	ING3	Q9NXR8	418 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	HACD3	Q9P035	362 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	SARDH	Q9UL12	918 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	CHKB	Q9Y259	395 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	CFAP54	Q96N23	3096 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	CACNA1E	Q15878	2313 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	PIEZO1	Q92508	2521 aa		5.63	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		5.62	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		5.62	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		5.62	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	RASGRF2	O14827	1237 aa		5.62	□□□□□ -1.51
DCTN1-222	ENST00000492717	TYROBP	O43914	113 aa		5.62	□□□□□ -1.51

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