RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa25.62■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa25.62■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM129AQ9BZQ8 928 aa25.62■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 SOHLH2Q9NX45 425 aa25.62■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD12Q6UB98 2062 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM159BA6NKW6 160 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 ISM1B1AKI9 464 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 GSTA2P09210 222 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 CBSLP0DN79 551 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 CBSP35520 551 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 CLN3Q13286 438 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM20CQ8IXL6 584 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 D2HGDHQ8N465 521 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 MCMBPQ9BTE3 642 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 BTRCQ9Y297 605 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 VWA7Q9Y334 891 aa25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 PCM1Q15154 2024 aa25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 KLK10O43240 276 aa25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 CATP04040 527 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 TUBB4BP68371 445 aa25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 TUBB3Q13509 450 aa25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 KIR2DS3Q14952 304 aa25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 RASGRP3Q8IV61 690 aa25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 MAGEC3Q8TD91 643 aa25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 ASB11Q8WXH4 323 aa25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 NFU1Q9UMS0 254 aa25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 SAT1P21673 171 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR19Q15760 415 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 C19orf48Q6RUI8 117 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 CYS1Q717R9 158 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 OR9A1PQ8NGU1 263 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 FBF1Q8TES7 1133 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 CDKL2Q92772 493 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 LINGO1Q96FE5 620 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 RHOJQ9H4E5 214 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 WDR70Q9NW82 654 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 GFYI3L273 518 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 LIPCP11150 499 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF28P17035 718 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 CD82P27701 267 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 RGS4P49798 205 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 TLE3Q04726 772 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 DTX1Q86Y01 620 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 CRELD1Q96HD1 420 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 VPS39Q96JC1 886 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 PKP4Q99569 1192 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 DPH1Q9BZG8 443 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 SPRY4Q9C004 299 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 FGF21Q9NSA1 209 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 SPATA7Q9P0W8 599 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4-202ENST00000483873 SPTBP11277 2137 aa25.58■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A0J9YY10 115 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 STMND1H3BQB6 276 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 MYO1CO00159 1063 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 TIAF1O95411 115 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 TSPAN12O95859 305 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 FGF5P12034 268 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 PSMB5P28074 263 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 ACY1Q03154 408 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF460Q14592 562 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 IL11RAQ14626 422 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 ZIC1Q15915 447 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC5A12Q1EHB4 618 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 CTAGE3PQ8IX95 158 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 DLG3Q92796 817 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 FMO2Q99518 471 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 ZPBPQ9BS86 351 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 NINJ2Q9NZG7 142 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 KLHL20Q9Y2M5 609 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 MYBL2P10244 700 aa25.56■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 ERGP11308 486 aa25.56■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 TAS2R39P59534 338 aa25.56■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 TMTC4Q5T4D3 741 aa25.56■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM207Q6UWW9 146 aa25.56■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 RAB42Q8N4Z0 105 aa25.56■■□□□ 1.68
GTF3C4-202ENST00000483873 PPM1NQ8N819 430 aa25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms