RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 KCNMB4Q86W47 210 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 PDIK1LQ8N165 341 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 SLC38A9Q8NBW4 561 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 SEC14L1Q92503 715 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 KCNJ9Q92806 393 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 MR1Q95460 341 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 FAM60AQ9NP50 221 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 CIDEBQ9UHD4 219 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 FBXO5Q9UKT4 447 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 MEN1O00255 615 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 CREG1O75629 220 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 FKBP9O95302 570 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 FAM87AP0C7U9 286 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 GPS2Q13227 327 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 CRYMQ14894 314 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ZIC1Q15915 447 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 SPANXN3Q5MJ09 141 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 IL17FQ96PD4 163 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 GALPQ9UBC7 116 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 BDKRB1P46663 353 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 CLCN7P51798 805 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ERV3-1Q14264 604 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 SF1Q15637 639 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 BBS9Q3SYG4 887 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ACSBG2Q5FVE4 666 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 DSELQ8IZU8 1212 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 TTI1O43156 1089 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF749O43361 778 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 OR2B3O76000 313 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 HAUS5O94927 633 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 PTPN4P29074 926 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 RORAP35398 523 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 DEFB109BQ30KR1 87 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 CCSMST1Q4G0I0 132 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 MSS51Q4VC12 460 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF549Q6P9A3 640 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 DNAJC22Q8N4W6 341 aa22.15■■□□□ 1.14
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PTPN4-208ENST00000460289 INPP5DQ92835 1189 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 LRRC39Q96DD0 335 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 ACTL8Q9H568 366 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 SPATA7Q9P0W8 599 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 PLCL2Q9UPR0 1127 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 DHRS7Q9Y394 339 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPN4-208ENST00000460289 NDC80O14777 642 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 CATP04040 527 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 MAGP20916 626 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 GABRA4P48169 554 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 POLE2P56282 527 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF605Q86T29 641 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 TAX1BP1Q86VP1 789 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 SNF8Q96H20 258 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 CHST8Q9H2A9 424 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 TUBD1Q9UJT1 453 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 POLHQ9Y253 713 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 FANCGO15287 622 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 VPS26AO75436 327 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 BANF1O75531 89 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 RAB40ALP0C0E4 278 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 ERVK-10P10266 1014 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 AGXTP21549 392 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 ITGA8P53708 1063 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 MPP1Q00013 466 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 DEFB110Q30KQ9 67 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 UGT3A1Q6NUS8 523 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 SYVN1Q86TM6 617 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPN4-208ENST00000460289 FAM20CQ8IXL6 584 aa22.13■■□□□ 1.13
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