RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 PSMG2Q969U7 264 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 CNTN6Q9UQ52 1028 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 BLMHQ13867 455 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 ADGRE1Q14246 886 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 CEP97Q8IW35 865 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 MAGEH1Q9H213 219 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 ADAM7Q9H2U9 754 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 CENPMQ9NSP4 180 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 PCDHGC3Q9UN70 934 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 WASF2Q9Y6W5 498 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 PRORSD1PA6NEY8 169 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 PTGS2P35354 604 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 GJA8P48165 433 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 AP1S1P61966 158 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 CAP1Q01518 475 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SP2Q02086 613 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SCARB2Q14108 478 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SLC24A5Q71RS6 500 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 ACOT12Q8WYK0 555 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 FCGR1BQ92637 280 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 NXPE2Q96DL1 559 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 PCBD2Q9H0N5 130 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 ZNF69Q9UC07 566 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 ALG5Q9Y673 324 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 TLL2Q9Y6L7 1015 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SHPRHQ149N8 1683 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.76■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 KAT7O95251 611 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 CBLBQ13191 982 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 NOGQ13253 232 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SGCBQ16585 318 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 BCL9O00512 1426 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 ZNF878C9JN71 531 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 NPHS1O60500 1241 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 ESR1P03372 595 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 CD36P16671 472 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 HTR7P34969 479 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 PTGER3P43115 390 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 OR12D2P58182 307 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 CRB2Q5IJ48 1285 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 GPR20Q99678 358 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 COL1A2P08123 1366 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 INMTO95050 263 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 PLGP00747 810 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 ZNF12P17014 697 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SEMG2Q02383 582 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 TMEM17Q86X19 198 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 CCDC107Q8WV48 283 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 PADI3Q9ULW8 664 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 NWD1Q149M9 1564 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 ITGA10O75578 1167 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 GNAZP19086 355 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 RBM34P42696 430 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 ABHD15Q6UXT9 468 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 MINDY2Q8NBR6 621 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 PRKD3O94806 890 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SLC7A1P30825 629 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 XKP51811 444 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 RABGGTBP53611 331 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SLC22A4Q9H015 551 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.75■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 A0A1W2PRB8 838 aa15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 HYKKA2RU49 373 aa15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 ZNF726A6NNF4 738 aa15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 TMEM44Q2T9K0 475 aa15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 HFE2Q6ZVN8 426 aa15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SPAG16Q8N0X2 631 aa15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 KCNC2Q96PR1 638 aa15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 OR2AG1Q9H205 316 aa15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 POMPQ9Y244 141 aa15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 CPQQ9Y646 472 aa15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
RXRA-201ENST00000356384 PCDH7O60245 1069 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms