RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329966.10

USP45-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP45, Length 1,444 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45-202ENST00000329966 LINGO1Q96FE5 620 aa20.37■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.37■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 OR6C1Q96RD1 312 aa20.37■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 PKP4Q99569 1192 aa20.37■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.37■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 FBXO8Q9NRD0 319 aa20.37■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.37■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.37■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 ESPNB1AK53 854 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 ISM1B1AKI9 464 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 MYO1CO00159 1063 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 MATN2O00339 956 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 ITPKBP27987 946 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 UGT3A1Q6NUS8 523 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 TTC23LQ6PF05 361 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 RELL1Q8IUW5 271 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 D2HGDHQ8N465 521 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 OR9A1PQ8NGU1 263 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 CDKL2Q92772 493 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 DDA1Q9BW61 102 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 CACNA1BQ00975 2339 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 SDK2Q58EX2 2172 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 A0A1W2PPV9 198 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 PSMB5P28074 263 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 YBX1P67809 324 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 HSD11B2P80365 405 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 GPR19Q15760 415 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 DCAF12Q5T6F0 453 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 RBBP8Q99708 897 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 CPNE1Q99829 537 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 SPRY4Q9C004 299 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 FAM60AQ9NP50 221 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 BTRCQ9Y297 605 aa20.36■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 HCRTR1O43613 425 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 TIAF1O95411 115 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 CATP04040 527 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 FAM153BP0C7A2 387 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 ZNF28P17035 718 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 STX2P32856 288 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 GP5P40197 560 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 CLN3Q13286 438 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 KIR2DS3Q14952 304 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 CYP2A13Q16696 494 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 FAM153CQ494X1 144 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 TEX35Q5T0J7 233 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 KMT5CQ86Y97 462 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 IFT20Q8IY31 132 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.35■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 A0A087WV48 116 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 KDM1AO60341 852 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 SPAG6O75602 509 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 ACSL3O95573 720 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 SLC16A8O95907 504 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 ERGP11308 486 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 GMPRP36959 345 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 ARL4DP49703 201 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 RGS4P49798 205 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 RAB15P59190 212 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 TUBB3Q13509 450 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 PHKG1Q16816 387 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 CARFQ8N187 725 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 FGF21Q9NSA1 209 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 PDE10AQ9Y233 779 aa20.34■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa20.33■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 SPTBP11277 2137 aa20.33■□□□□ 0.85
USP45-202ENST00000329966 A0A0J9YY10 115 aa20.33■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa20.33■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 MYBL2P10244 700 aa20.33■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 IL2P60568 153 aa20.33■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms