RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 ACSBG2Q5FVE4 666 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 TMEM207Q6UWW9 146 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 NAPRTQ6XQN6 538 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 NEK10Q6ZWH5 1172 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 ANKRD49Q8WVL7 239 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 UBXN10Q96LJ8 280 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 GSDMCQ9BYG8 508 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 DERL2Q9GZP9 239 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.53■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 CCDC189A1A4V9 331 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 NOBOXO60393 691 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 SPAG7O75391 227 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 SLCO2B1O94956 709 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 SFTPCP11686 197 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 HGFP14210 728 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 HPDP32754 393 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 CRHR1P34998 444 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 PREPP48147 710 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 CLCNKAP51800 687 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 CTBSQ01459 385 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 TGIF1Q15583 401 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 MANEAQ5SRI9 462 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 METRNLQ641Q3 311 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 SLC22A15Q8IZD6 547 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 NXNL1Q96CM4 212 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 SCYL1Q96KG9 808 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 SELENOSQ9BQE4 189 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 TMEM168Q9H0V1 697 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 DPEP2Q9H4A9 486 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 KCNK9Q9NPC2 374 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 IL17BQ9UHF5 180 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 CDYLQ9Y232 598 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 KCNK6Q9Y257 313 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 ATMQ13315 3056 aa15.52■□□□□ 0.08
IFT20-201ENST00000322326 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 H3BQF6 201 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 BTN3A1O00481 513 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 TYROBPO43914 113 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 TSPAN12O95859 305 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 RBP1P09455 135 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 CD1DP15813 335 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 CREB1P16220 341 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 GMPRP36959 345 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 ACTR1BP42025 376 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 ACTR1AP61163 376 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 ACAP2Q15057 778 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 ATG14Q6ZNE5 492 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 SPATA6LQ8N4H0 392 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 GPR156Q8NFN8 814 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 EXTL1Q92935 676 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 FOPNLQ96NB1 174 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 CMKLR1Q99788 373 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.51■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 PRR19A6NJB7 356 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 TM9SF1O15321 606 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 ZWINTO95229 277 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 PNLIPP16233 465 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 GLB1P16278 677 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 TFEBP19484 476 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 NR1D1P20393 614 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 HALP42357 657 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 GLRBP48167 497 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 PPP2R2AP63151 447 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 DLG1Q12959 904 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 SP140Q13342 867 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 CCDC153Q494R4 210 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 TAF8Q7Z7C8 310 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 VRK3Q8IV63 474 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 GPBAR1Q8TDU6 330 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 TRIM4Q9C037 500 aa15.5■□□□□ 0.07
IFT20-201ENST00000322326 OR52A5Q9H2C5 316 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms