RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cnga4Q3UW12 575 aa29.58■■■□□ 2.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Clec4a4Q5YIR8 236 aa29.58■■■□□ 2.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Stmnd1Q6P3A1 279 aa29.58■■■□□ 2.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TwistnbQ78WZ7 330 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmcc2Q80W04 706 aa29.58■■■□□ 2.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GgnQ80WJ1 673 aa29.58■■■□□ 2.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PstkQ8BP74 359 aa29.58■■■□□ 2.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Agfg1Q8K2K6 561 aa29.58■■■□□ 2.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cxxc5Q91WA4 317 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AasdhpptQ9CQF6 309 aa29.58■■■□□ 2.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atp5oQ9DB20 213 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 FanceB8JJD6 213 aa29.57■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wipf3P0C7L0 485 aa29.57■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 LcorlQ3U285 600 aa29.57■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr299Q7TS05 330 aa29.57■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tceal3Q8R0A5 200 aa29.57■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ankrd49Q8VE42 238 aa29.57■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmigd1Q9D7L8 261 aa29.57■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PiggD3Z3Y1 983 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 IkbkgO88522 412 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kcnc1P15388 511 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ckmt1P30275 418 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GlaP51569 419 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rbp1Q00915 135 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Creb1Q01147 341 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Grid1Q61627 1009 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 RbsnQ80Y56 783 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 DseQ8BLI4 958 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Peli3Q8BXR6 445 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Grhl2Q8K5C0 625 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Glra3Q91XP5 464 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NgrnQ99KS2 293 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mxra7Q9CZH7 178 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Uba7Q9DBK7 977 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm42641I6L9G2 585 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Glycam1Q02596 151 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sim1Q61045 765 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Krt77Q6IFZ6 572 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1037Q7TR84 321 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Clec18aQ7TSQ1 534 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tnfaip8l2Q9D8Y7 184 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pfn3Q9DAD6 137 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 IcmtQ9EQK7 283 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 HcstQ9QUJ0 79 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Copg1Q9QZE5 874 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dock4P59764 1978 aa29.56■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zmynd12A2BGJ5 363 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr596F8VQ26 312 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zw10O54692 779 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AurkcO88445 282 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dll3O88516 592 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CatP24270 527 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arntl2Q2VPD4 579 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Togaram2Q3TYG6 1002 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 XiapQ60989 496 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 LssQ8BLN5 733 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 E330017A01RikQ8BU47 192 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr315Q8VFG7 309 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Capn8Q91VA3 703 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chchd2Q9D1L0 153 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Shcbp1Q9Z179 668 aa29.55■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm3373A6NAS7 205 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chst13D3Z6E3 336 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klk1P15947 261 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CtskP55097 329 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NrtnP97463 195 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 JrkQ60976 557 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GcgrQ61606 485 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hesx1Q61658 185 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dna2Q6ZQJ5 1062 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PolnQ7TQ07 864 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gxylt2Q810K9 444 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Snx8Q8CFD4 459 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abhd11Q8K4F5 307 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SharpinQ91WA6 380 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ucn3Q924A4 164 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abcf2Q99LE6 628 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ssu72Q9CY97 194 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arr3Q9EQP6 381 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lgals8Q9JL15 316 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa29.54■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MagohP61327 146 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mapk10Q61831 464 aa29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PigaQ64323 485 aa29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Usp8Q80U87 1080 aa29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sra1Q80VJ2 232 aa29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klrb1fQ8VD98 217 aa29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hdac11Q91WA3 347 aa29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MagohbQ9CQL1 146 aa29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wdr55Q9CX97 388 aa29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 FopnlQ9CZS3 174 aa29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 5330417H12RikQ9D3P2 110 aa29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa29.53■■■□□ 2.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp607bG3X9H3 648 aa29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.9 ms