RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Bcl10Q9Z0H7 233 aa6.9□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa6.9□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 9230113P08RikD3YWX3 137 aa6.9□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm9857F7CXR1 130 aa6.9□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 PrlP06879 226 aa6.9□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 SpnP15702 395 aa6.9□□□□□ -1.3
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Flot2Q60634 428 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Q8BHB7 409 aa6.9□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp101Q8BP18 612 aa6.9□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fam118aQ91YN1 357 aa6.9□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Camk2gQ923T9 529 aa6.9□□□□□ -1.3
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm7145A0A087WS64 360 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pkd2l1A2A259 760 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm14781A2A9Q9 366 aa6.9□□□□□ -1.31
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Adcyap1r1P70205 496 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 TekQ02858 1122 aa6.9□□□□□ -1.31
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Znf280cQ6P3Y5 742 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mfn2Q80U63 757 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Clec2eQ80XD9 204 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lrrtm4Q80XG9 590 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Bpifb3Q80ZU7 473 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm21627Q810R0 219 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fbxw8Q8BIA4 598 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gtf3c2Q8BL74 907 aa6.9□□□□□ -1.31
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Trpv3Q8K424 791 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cops8Q8VBV7 209 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Necab2Q91ZP9 389 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 HnrnpllQ921F4 591 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Edem1Q925U4 652 aa6.9□□□□□ -1.31
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Trps1-201ENSMUST00000077935 P2yr13Q9D8I2 337 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hes6Q9JHE6 224 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dclk1Q9JLM8 756 aa6.9□□□□□ -1.31
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Rhox13F6YCR7 232 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm3159K7N760 267 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ptch2O35595 1182 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 NmbrO54799 390 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dmp1O55188 503 aa6.9□□□□□ -1.31
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Lin7bO88951 207 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 DhfrP00375 187 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gpr143P70259 405 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Polr1bP70700 1135 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fut7Q11131 389 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ankdd1bQ14DN9 521 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ulk3Q3U3Q1 472 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nr0b1Q61066 472 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp759Q7M6X3 721 aa6.9□□□□□ -1.31
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Trps1-201ENSMUST00000077935 Q8BHR8 331 aa6.9□□□□□ -1.31
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Trps1-201ENSMUST00000077935 NarfQ9CYQ7 462 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 5330417H12RikQ9D3P2 110 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Haus5Q9D786 619 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Actrt2Q9D9L5 377 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 TsaccQ9DA44 124 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Trpv4Q9EPK8 871 aa6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr675A0A1B0GSE1 317 aa6.89□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm7275E9Q1B3 247 aa6.89□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa6.89□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm20509G3UZF1 325 aa6.89□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Stxbp1O08599 594 aa6.89□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 H2-Q7P14429 334 aa6.89□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 H2-Q9P14431 200 aa6.89□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ephb2P54763 986 aa6.89□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Copz1P61924 177 aa6.89□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 NfycP70353 335 aa6.89□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Txnl4aP83877 142 aa6.89□□□□□ -1.31
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