RNA–Protein interactions for RNA: YHL039W

EFM1, Transcript of Lysine methyltransferase, yeast

Gene EFM1, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EFM1	YHL039W	YPL109C	Q02981	657 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	OPI1	P21957	404 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	SPO11	P23179	398 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	AKR1	P39010	764 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	SOV1	Q04748	898 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	PSR2	Q07949	397 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	PIF1	P07271	859 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	PDR1	P12383	1068 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	IME1	P21190	360 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	CLB4	P24871	460 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	BUD14	P27637	709 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	RPC25	P35718	212 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	LAM1	P38851	1228 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	VPS53	P47061	822 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	HFM1	P51979	1187 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	YNL193W	P53870	558 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	FCP1	Q03254	732 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	ARO80	Q04052	950 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	TFB4	Q12004	338 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	CKI1	P20485	582 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	CBP3	P21560	335 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	VAN1	P23642	535 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	PSO2	P30620	661 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	URH1	Q04179	340 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	YPR109W	Q06104	294 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	RAM1	P22007	431 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	SIT1	P39980	628 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	VFA1	P40080	203 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	PXA1	P41909	870 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	MEC3	Q02574	474 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	YRR1	Q12172	810 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	GRX7	P38068	203 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	IES1	P43579	692 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	MFM1	Q02783	413 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	EST2	Q06163	884 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	NKP1	Q12493	238 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	PTC5	Q12511	572 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	RSF2	P46974	1380 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	OAF3	P36023	863 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	BNI4	P53858	892 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	GTR1	Q00582	310 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	UBP16	Q02863	499 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	VTI1	Q04338	217 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	TAF9	Q05027	157 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	MMR1	Q06324	491 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	YOL075C	Q08234	1294 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	AIM7	Q12156	149 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	YBR062C	P38239	180 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	YKU80	Q04437	629 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	ORM2	Q06144	216 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	YPR015C	Q12531	247 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	SAC3	P46674	1301 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	KAR3	P17119	729 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	RER2	P35196	286 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	FZO1	P38297	855 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	YIL001W	P40560	513 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	MAD1	P40957	749 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	APL6	P46682	809 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	PKH1	Q03407	766 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	FAR8	Q05040	523 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	PIG1	Q06216	648 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	SLM3	Q12093	417 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFM1	YHL039W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
EFM1	YHL039W	PIH1	P38768	344 aa		7.46	□□□□□ -1.22
EFM1	YHL039W	REV7	P38927	245 aa		7.46	□□□□□ -1.22

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