RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641928.1

MFSD8-255, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 4,083 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-255	ENST00000641928	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	ATG7	O95352	703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	SNX21	Q969T3	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	TCF3	P15923	654 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	NUCB2	P80303	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	DMTN	Q08495	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	KIAA0556	O60303	1618 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	FEZ1	Q99689	392 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	IFT140	Q96RY7	1462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	NUP160	Q12769	1436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	POGK	Q9P215	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	LHX6	Q9UPM6	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	MBD5	Q9P267	1494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	LAMC1	P11047	1609 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	KDM5C	P41229	1560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	STK32A	Q8WU08	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	CLCN6	P51797	869 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	MBD3	O95983	291 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	USP17L8	P0C7I0	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	SSFA2	P28290	1259 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	DEPDC5	O75140	1603 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	SYCP1	Q15431	976 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	UVSSA	Q2YD98	709 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	PROX2	Q3B8N5	592 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	GRIN2B	Q13224	1484 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	ZNF445	P59923	1031 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	TMF1	P82094	1093 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MFSD8-255	ENST00000641928	POTEM	A6NI47	508 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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