RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RUNDC1	Q96C34	613 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMX3	Q96JJ7	454 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATP10A	O60312	1499 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATP2B1	P20020	1258 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CLCN6	P51797	869 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NPHP1	O15259	732 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TEX35	Q5T0J7	233 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DONSON	Q9NYP3	566 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694		A0A1B0GUL7	405 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USP27X	A6NNY8	438 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC27	Q2M243	656 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CLTCL1	P53675	1640 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GCC1	Q96CN9	775 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NOS1	P29475	1434 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SATB1	Q01826	763 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CUL4A	Q13619	759 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	E2F4	Q16254	413 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SHPRH	Q149N8	1683 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RERE	Q9P2R6	1566 aa		10.4	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TPM4	P67936	248 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MYOM1	P52179	1685 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SUFU	Q9UMX1	484 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	10.39	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CFAP44	Q96MT7	982 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC189	A1A4V9	331 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAGEA9	P43362	315 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NEK4	P51957	841 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UBE2H	P62256	183 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PTPN14	Q15678	1187 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TTC22	Q5TAA0	569 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RNF20	Q5VTR2	975 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CEP120	Q8N960	986 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RICTOR	Q6R327	1708 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LUZP1	Q86V48	1076 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IQUB	Q8NA54	791 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DEF6	Q9H4E7	631 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GPS2	Q13227	327 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DRC7	Q8IY82	874 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.37	□□□□□ -0.75

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