RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628455.2

PCBP1-AS1-329, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 361 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.67□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.67□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ITPK1Q13572 414 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SMIM5Q71RC9 77 aa14.65□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.64□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.64□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 C5P01031 1676 aa14.63□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 HMOX1P09601 288 aa14.63□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.63□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 C4BP0C0L5 1744 aa14.62□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ADRA2BP18089 450 aa14.62□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RFC4P35249 363 aa14.62□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.62□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.62□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 KDRP35968 1356 aa14.61□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RPS6KA4O75676 772 aa14.6□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.6□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ITGB4P16144 1822 aa14.59□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MMP10P09238 476 aa14.59□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CFAP53Q96M91 514 aa14.59□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.59□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.58□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.58□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 LGR6Q9HBX8 967 aa14.57□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.57□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.57□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.56□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.56□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.55□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.55□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NUDCQ9Y266 331 aa14.55□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 GYS1P13807 737 aa14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TGFB2P61812 414 aa14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZPR1O75312 459 aa14.53□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TEFQ10587 303 aa14.53□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SLC39A6Q13433 755 aa14.53□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.52□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.51□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 C1QTNF8P60827 252 aa14.51□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 A0A0G2JLW4 131 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 STARD3NLO95772 234 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 BCS1LQ9Y276 419 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 FKBP8Q14318 412 aa14.49□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NEFMP07197 916 aa14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PRKAR2BP31323 418 aa14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 FCHSD2O94868 740 aa14.47□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 DPEP1P16444 411 aa14.47□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.47□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 IL17REQ8NFR9 667 aa14.47□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 UTRNP46939 3433 aa14.47□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 A0A087WZG4 1122 aa14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PPP2R1AP30153 589 aa14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZNF790Q6PG37 636 aa14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PIM2Q9P1W9 311 aa14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CHD4Q14839 1912 aa14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 BTBD11A6QL63 1104 aa14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ATP10DQ9P241 1426 aa14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 NARFQ9UHQ1 456 aa14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.44□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-329ENST00000628455 MRC1P22897 1456 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms