RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HTRA3P83110 453 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FSTL1Q12841 308 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ITPK1Q13572 414 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNS4Q8IZW8 715 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 JMYQ8N9B5 988 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TESK2Q96S53 571 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DPEP1P16444 411 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.52■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TONSLQ96HA7 1378 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RFC4P35249 363 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADRA2BP18089 450 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRELPP51888 382 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATG3Q9NT62 314 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.038e-7■■□□□ 11.4
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PIM2Q9P1W9 311 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RRAGCQ9HB90 399 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RNF181Q9P0P0 153 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PHKG2P15735 406 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GYS1P13807 737 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C4AP0C0L4 1744 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCNA3P22001 575 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NCAPD2Q15021 1401 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RPS6KA4O75676 772 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DCAF5Q96JK2 942 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EYA1Q99502 592 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDRP35968 1356 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDCA8Q53HL2 280 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHRNA5P30532 468 aa21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CABP4P57796 275 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FKBP8Q14318 412 aa21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DDR1Q08345 913 aa21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RASSF7Q02833 373 aa21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PCNTO95613 3336 aa21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GLTPD2A6NH11 291 aa21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LMNB1P20700 586 aa21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POLKQ9UBT6 870 aa21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZPR1O75312 459 aa21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MTHFSP49914 203 aa21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SBF1O95248 1867 aa21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TM4SF1P30408 202 aa21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TTLL6Q8N841 843 aa21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 H0YIN7 160 aa21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NFIXQ14938 502 aa21.17■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms