RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 KRT24Q2M2I5 525 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 PDE3AQ14432 1141 aa18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 GLI3P10071 1580 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 TNS2Q63HR2 1409 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-227ENST00000598960 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 DCAF5Q96JK2 942 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 DOT1LQ8TEK3 1739 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 HSPA1LP34931 641 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 USP35Q9P2H5 1018 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 BTBD11A6QL63 1104 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 MS4A1P11836 297 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 TNNQ9UQP3 1299 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 BCL9LQ86UU0 1499 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 TRIM27P14373 513 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 PANK1Q8TE04 598 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 KAT6BQ8WYB5 2073 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 HOXB7P09629 217 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 RLBP1P12271 317 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-227ENST00000598960 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 KCNQ3O43525 872 aa18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 RGS12O14924 1447 aa18.07■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 UNC5CLQ8IV45 518 aa18.07■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 C8orf37Q96NL8 207 aa18.07■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 COG6Q9Y2V7 657 aa18.07■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 CLUAP1Q96AJ1 413 aa18.06■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 ABCC4O15439 1325 aa18.05■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 KCPQ6ZWJ8 1503 aa18.05■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 MVPQ14764 893 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.05■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 BARGINQ6ZT62 677 aa18.05■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 NGLY1Q96IV0 654 aa18.05■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.05■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 ERVV-2B6SEH9 535 aa18.04■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 CABP4P57796 275 aa18.04■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 VPS72Q15906 364 aa18.04■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.04■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 PTPRCP08575 1304 aa18.03■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF790Q6PG37 636 aa18.03■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 STK31Q9BXU1 1019 aa18.03■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 AAMPQ13685 434 aa18.02■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.02■□□□□ 0.48
FCHO1-227ENST00000598960 EXOC5O00471 708 aa18.01■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 SLC39A6Q13433 755 aa18.01■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.01■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.01■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.01■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 SLC4A2P04920 1241 aa18■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 ITPRIPQ8IWB1 547 aa17.99■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 TTC5Q8N0Z6 440 aa17.99■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 USP21Q9UK80 565 aa17.99■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 DDX19BQ9UMR2 479 aa17.99■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 ATRNO75882 1429 aa17.98■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 DDB1Q16531 1140 aa17.98■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 G2E3Q7L622 706 aa17.98■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 NECTIN2Q92692 538 aa17.98■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 FLIIQ13045 1269 aa17.97■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 FMNL2Q96PY5 1086 aa17.97■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 TJP1Q07157 1748 aa17.97■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 BCL9O00512 1426 aa17.97■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 AFF2P51816 1311 aa17.97■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 TMOD3Q9NYL9 352 aa17.96■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 CHPF2Q9P2E5 772 aa17.96■□□□□ 0.47
FCHO1-227ENST00000598960 SBF2Q86WG5 1849 aa17.95■□□□□ 0.46
FCHO1-227ENST00000598960 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa17.95■□□□□ 0.46
FCHO1-227ENST00000598960 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa17.95■□□□□ 0.46
FCHO1-227ENST00000598960 NHSQ6T4R5 1651 aa17.95■□□□□ 0.46
FCHO1-227ENST00000598960 KDM2BQ8NHM5 1336 aa17.95■□□□□ 0.46
FCHO1-227ENST00000598960 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms