RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591848.1

AFG3L2-204, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene AFG3L2, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-204ENST00000591848 GPR162Q16538 588 aa23.41■■□□□ 1.34
AFG3L2-204ENST00000591848 C4BP0C0L5 1744 aa23.41■■□□□ 1.34
AFG3L2-204ENST00000591848 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.41■■□□□ 1.34
AFG3L2-204ENST00000591848 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.4■■□□□ 1.34
AFG3L2-204ENST00000591848 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
AFG3L2-204ENST00000591848 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 SSFA2P28290 1259 aa23.38■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 ITPK1Q13572 414 aa23.38■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 KDRP35968 1356 aa23.38■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 GNPATO15228 680 aa23.37■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 HMOX1P09601 288 aa23.36■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 SMIM5Q71RC9 77 aa23.36■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.35■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.35■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.34■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.34■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.34■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.33■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
AFG3L2-204ENST00000591848 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.32■■□□□ 1.32
AFG3L2-204ENST00000591848 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2-204ENST00000591848 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2-204ENST00000591848 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2-204ENST00000591848 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2-204ENST00000591848 CHD4Q14839 1912 aa23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2-204ENST00000591848 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
AFG3L2-204ENST00000591848 GRIN3BO60391 1043 aa23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2-204ENST00000591848 LGR6Q9HBX8 967 aa23.27■■□□□ 1.32
AFG3L2-204ENST00000591848 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 RPS6KA4O75676 772 aa23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 ADRA2BP18089 450 aa23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 CFAP53Q96M91 514 aa23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 RFC4P35249 363 aa23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 MMP10P09238 476 aa23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.313e-6■■■□□ 17.9
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AFG3L2-204ENST00000591848 NUDCQ9Y266 331 aa23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2-204ENST00000591848 SLC39A6Q13433 755 aa23.19■■□□□ 1.3
AFG3L2-204ENST00000591848 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.19■■□□□ 1.3
AFG3L2-204ENST00000591848 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
AFG3L2-204ENST00000591848 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
AFG3L2-204ENST00000591848 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.17■■□□□ 1.3
AFG3L2-204ENST00000591848 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
AFG3L2-204ENST00000591848 GYS1P13807 737 aa23.16■■□□□ 1.3
AFG3L2-204ENST00000591848 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.16■■□□□ 1.3
AFG3L2-204ENST00000591848 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.16■■□□□ 1.3
AFG3L2-204ENST00000591848 PPP2R1AP30153 589 aa23.15■■□□□ 1.3
AFG3L2-204ENST00000591848 TEFQ10587 303 aa23.15■■□□□ 1.3
AFG3L2-204ENST00000591848 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.15■■□□□ 1.3
AFG3L2-204ENST00000591848 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.15■■□□□ 1.3
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AFG3L2-204ENST00000591848 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 MRC1P22897 1456 aa23.12■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 PRKAR2BP31323 418 aa23.12■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.12■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.12■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 ZPR1O75312 459 aa23.11■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 TGFB2P61812 414 aa23.11■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 IL17REQ8NFR9 667 aa23.11■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 TJP1Q07157 1748 aa23.11■■□□□ 1.29
AFG3L2-204ENST00000591848 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.1■■□□□ 1.29
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AFG3L2-204ENST00000591848 STARD3NLO95772 234 aa23.08■■□□□ 1.29
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AFG3L2-204ENST00000591848 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.08■■□□□ 1.29
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AFG3L2-204ENST00000591848 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
AFG3L2-204ENST00000591848 C4AP0C0L4 1744 aa23.06■■□□□ 1.28
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AFG3L2-204ENST00000591848 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.05■■□□□ 1.28
AFG3L2-204ENST00000591848 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
AFG3L2-204ENST00000591848 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
AFG3L2-204ENST00000591848 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
AFG3L2-204ENST00000591848 NARFQ9UHQ1 456 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L2-204ENST00000591848 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L2-204ENST00000591848 UTRNP46939 3433 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L2-204ENST00000591848 BTBD11A6QL63 1104 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L2-204ENST00000591848 NEFMP07197 916 aa23.03■■□□□ 1.28
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AFG3L2-204ENST00000591848 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.03■■□□□ 1.28
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