RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-209ENST00000591760 MSH5O43196 834 aa34.63■■■■□ 3.13
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PTPRS-209ENST00000591760 ATP6V1AP38606 617 aa34.62■■■■□ 3.13
PTPRS-209ENST00000591760 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
PTPRS-209ENST00000591760 UBR3Q6ZT12 1888 aa34.62■■■■□ 3.13
PTPRS-209ENST00000591760 PPP2R1AP30153 589 aa34.61■■■■□ 3.13
PTPRS-209ENST00000591760 LINC00116Q8NCU8 138 aa34.59■■■■□ 3.13
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PTPRS-209ENST00000591760 ITPK1Q13572 414 aa34.58■■■■□ 3.13
PTPRS-209ENST00000591760 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
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PTPRS-209ENST00000591760 MRC1P22897 1456 aa34.57■■■■□ 3.12
PTPRS-209ENST00000591760 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
PTPRS-209ENST00000591760 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa34.56■■■■□ 3.12
PTPRS-209ENST00000591760 MAP3K5Q99683 1374 aa34.55■■■■□ 3.12
PTPRS-209ENST00000591760 DCAF8L1A6NGE4 600 aa34.55■■■■□ 3.12
PTPRS-209ENST00000591760 NUDCQ9Y266 331 aa34.55■■■■□ 3.12
PTPRS-209ENST00000591760 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
PTPRS-209ENST00000591760 SYT17Q9BSW7 474 aa34.54■■■■□ 3.12
PTPRS-209ENST00000591760 SSFA2P28290 1259 aa34.53■■■■□ 3.12
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PTPRS-209ENST00000591760 PHF14O94880 888 aa34.51■■■■□ 3.12
PTPRS-209ENST00000591760 GNPATO15228 680 aa34.5■■■■□ 3.11
PTPRS-209ENST00000591760 GAS2L2Q8NHY3 880 aa34.5■■■■□ 3.11
PTPRS-209ENST00000591760 SLC4A9Q96Q91 983 aa34.5■■■■□ 3.11
PTPRS-209ENST00000591760 LGR6Q9HBX8 967 aa34.5■■■■□ 3.11
PTPRS-209ENST00000591760 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
PTPRS-209ENST00000591760 AMIGO3Q86WK7 504 aa34.49■■■■□ 3.11
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PTPRS-209ENST00000591760 MSL1Q68DK7 614 aa34.47■■■■□ 3.11
PTPRS-209ENST00000591760 RSPH6AQ9H0K4 717 aa34.46■■■■□ 3.11
PTPRS-209ENST00000591760 PRKAR2BP31323 418 aa34.45■■■■□ 3.11
PTPRS-209ENST00000591760 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa34.45■■■■□ 3.11
PTPRS-209ENST00000591760 TJP1Q07157 1748 aa34.44■■■■□ 3.1
PTPRS-209ENST00000591760 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
PTPRS-209ENST00000591760 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP34.44■■■■□ 3.1
PTPRS-209ENST00000591760 KLHL34Q8N239 644 aa34.44■■■■□ 3.1
PTPRS-209ENST00000591760 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
PTPRS-209ENST00000591760 GNAT3A8MTJ3 354 aa34.42■■■■□ 3.1
PTPRS-209ENST00000591760 SMIM5Q71RC9 77 aa34.42■■■■□ 3.1
PTPRS-209ENST00000591760 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
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PTPRS-209ENST00000591760 PHACTR3Q96KR7 559 aa34.38■■■■□ 3.09
PTPRS-209ENST00000591760 KCPQ6ZWJ8 1503 aa34.37■■■■□ 3.09
PTPRS-209ENST00000591760 ADRA2BP18089 450 aa34.37■■■■□ 3.09
PTPRS-209ENST00000591760 TRAPPC3LQ5T215 181 aa34.37■■■■□ 3.09
PTPRS-209ENST00000591760 UBR2Q8IWV8 1755 aa34.36■■■■□ 3.09
PTPRS-209ENST00000591760 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
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PTPRS-209ENST00000591760 TEFQ10587 303 aa34.35■■■■□ 3.09
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PTPRS-209ENST00000591760 RALBP1Q15311 655 aa34.33■■■■□ 3.09
PTPRS-209ENST00000591760 IL17REQ8NFR9 667 aa34.33■■■■□ 3.09
PTPRS-209ENST00000591760 TTC5Q8N0Z6 440 aa34.31■■■■□ 3.08
PTPRS-209ENST00000591760 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa34.31■■■■□ 3.08
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PTPRS-209ENST00000591760 VSIG10Q8N0Z9 540 aa34.29■■■■□ 3.08
PTPRS-209ENST00000591760 NLGN2Q8NFZ4 835 aa34.29■■■■□ 3.08
PTPRS-209ENST00000591760 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
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PTPRS-209ENST00000591760 RFC4P35249 363 aa34.28■■■■□ 3.08
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PTPRS-209ENST00000591760 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
PTPRS-209ENST00000591760 NEFMP07197 916 aa34.26■■■■□ 3.08
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PTPRS-209ENST00000591760 CCDC87Q9NVE4 849 aa34.25■■■■□ 3.07
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PTPRS-209ENST00000591760 MMP10P09238 476 aa34.21■■■■□ 3.07
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PTPRS-209ENST00000591760 STARD3NLO95772 234 aa34.16■■■■□ 3.06
PTPRS-209ENST00000591760 FMNL2Q96PY5 1086 aa34.16■■■■□ 3.06
PTPRS-209ENST00000591760 CHD4Q14839 1912 aa34.16■■■■□ 3.06
PTPRS-209ENST00000591760 DLG5Q8TDM6 1919 aa34.16■■■■□ 3.06
PTPRS-209ENST00000591760 PLEKHF1Q96S99 279 aa34.15■■■■□ 3.06
PTPRS-209ENST00000591760 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
PTPRS-209ENST00000591760 COL15A1P39059 1388 aa34.14■■■■□ 3.06
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