RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 IL13P35225 146 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 UTRNP46939 3433 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 C4BP0C0L5 1744 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 KDRP35968 1356 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 MTHFSP49914 203 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 ARXQ96QS3 562 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 SYT17Q9BSW7 474 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 CHD4Q14839 1912 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 DCAF5Q96JK2 942 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 POLD1P28340 1107 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 SIK1P57059 783 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 ATG3Q9NT62 314 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF831Q5JPB2 1677 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 MAP3K5Q99683 1374 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP6V1AP38606 617 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 CABP4P57796 275 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 ITPK1Q13572 414 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 AK7Q96M32 723 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 HMOX1P09601 288 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 POTEMA6NI47 508 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 PHF14O94880 888 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 YY1P25490 414 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 SSFA2P28290 1259 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 PPP2R1AP30153 589 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 MSL1Q68DK7 614 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 SMIM5Q71RC9 77 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 GNPATO15228 680 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 RALBP1Q15311 655 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 KLHL34Q8N239 644 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 TJP1Q07157 1748 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 LGR6Q9HBX8 967 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 C4AP0C0L4 1744 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-210ENST00000588340 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 28
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR162Q16538 588 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 MRC1P22897 1456 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 CFAP53Q96M91 514 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 UBR2Q8IWV8 1755 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 RPS6KA4O75676 772 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 CRKLP46109 303 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC39A6Q13433 755 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 KCPQ6ZWJ8 1503 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 GNAT3A8MTJ3 354 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 RFC4P35249 363 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 IL17REQ8NFR9 667 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-210ENST00000588340 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms