RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.14□□□□□ -0.63
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GGA3-218ENST00000584243 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 ANP32CO43423 234 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 C4BP0C0L5 1744 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 PHF14O94880 888 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 NLRP13Q86W25 1043 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 ACEP12821 1306 aa11.11□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.11□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 CAPNS2Q96L46 248 aa11.11□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.1□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
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GGA3-218ENST00000584243 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.1□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
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GGA3-218ENST00000584243 CEP290O15078 2479 aa11.1□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 AOC2O75106 756 aa11.09□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 LMNB1P20700 586 aa11.09□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
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GGA3-218ENST00000584243 POGKQ9P215 609 aa11.09□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.08□□□□□ -0.64
GGA3-218ENST00000584243 IL2RBP14784 551 aa11.08□□□□□ -0.64
GGA3-218ENST00000584243 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.08□□□□□ -0.64
GGA3-218ENST00000584243 LDHDQ86WU2 507 aa11.08□□□□□ -0.64
GGA3-218ENST00000584243 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
GGA3-218ENST00000584243 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.08□□□□□ -0.64
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GGA3-218ENST00000584243 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
GGA3-218ENST00000584243 C4AP0C0L4 1744 aa11.06□□□□□ -0.64
GGA3-218ENST00000584243 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.06□□□□□ -0.64
GGA3-218ENST00000584243 USP47Q96K76 1375 aa11.05□□□□□ -0.64
GGA3-218ENST00000584243 CA12O43570 354 aa11.05□□□□□ -0.64
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GGA3-218ENST00000584243 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
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GGA3-218ENST00000584243 CHRNA5P30532 468 aa11.04□□□□□ -0.64
GGA3-218ENST00000584243 AK7Q96M32 723 aa11.04□□□□□ -0.64
GGA3-218ENST00000584243 LAMA3Q16787 3333 aa11.04□□□□□ -0.64
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GGA3-218ENST00000584243 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
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GGA3-218ENST00000584243 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
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GGA3-218ENST00000584243 LINC00116Q8NCU8 138 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-218ENST00000584243 ZIC5Q96T25 663 aa10.98□□□□□ -0.65
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GGA3-218ENST00000584243 HTTP42858 3142 aa10.96□□□□□ -0.66
GGA3-218ENST00000584243 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
GGA3-218ENST00000584243 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
GGA3-218ENST00000584243 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
GGA3-218ENST00000584243 NBPF1Q3BBV0 1214 aa10.95□□□□□ -0.66
GGA3-218ENST00000584243 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
GGA3-218ENST00000584243 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.95□□□□□ -0.66
GGA3-218ENST00000584243 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.95□□□□□ -0.66
GGA3-218ENST00000584243 SOX12O15370 315 aa10.94□□□□□ -0.66
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