RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-215ENST00000583289 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-215ENST00000583289 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-215ENST00000583289 WHAMMQ8TF30 809 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-215ENST00000583289 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-215ENST00000583289 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-215ENST00000583289 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-215ENST00000583289 COG6Q9Y2V7 657 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-215ENST00000583289 GPR25O00155 361 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGEF15O94989 841 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 TLR1Q15399 786 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 PGBD3Q8N328 593 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 IGF1RP08069 1367 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 RAD21O60216 631 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 INHAP05111 366 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 MX2P20592 715 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 PHKA2P46019 1235 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 SCNN1DP51172 638 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 FLIIQ13045 1269 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 C4orf17Q53FE4 359 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 GPAMQ9HCL2 828 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 PHF24Q9UPV7 400 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 GSK3AP49840 483 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 GDF10P55107 478 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 RASSF7Q02833 373 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 EFHC2Q5JST6 749 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-215ENST00000583289 GDF11O95390 407 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 BCRP11274 1271 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 MSX1P28360 303 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 MAP2K3P46734 347 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 EML3Q32P44 896 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 KANK3Q6NY19 840 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 ALG2Q9H553 416 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 THBS1P07996 1170 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 PLA2G4AP47712 749 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 SMTNP53814 917 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 RUBCNLQ9H714 662 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 PIK3CDO00329 1044 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 SKIP12755 728 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 POM121Q96HA1 1249 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 NOD1Q9Y239 953 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 IRS1P35568 1242 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 ACDQ96AP0 544 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 BACH1O14867 736 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 MTFR1Q15390 333 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 PODNQ7Z5L7 613 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 A6NJY4 79 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 CDK2AP1O14519 115 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 NCOA4Q13772 614 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 NLRP8Q86W28 1048 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-215ENST00000583289 USP17L5A8MUK1 530 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 OIP5O43482 229 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 ATP4AP20648 1035 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 GTF2IP78347 998 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 PSME1Q06323 249 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 AIDAQ96BJ3 306 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 FGFR3P22607 806 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 TRIM50Q86XT4 487 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-215ENST00000583289 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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