RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ITPK1Q13572 414 aa38.5■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AMOTQ4VCS5 1084 aa38.5■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AEBP1Q8IUX7 1158 aa38.5■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DCAF5Q96JK2 942 aa38.5■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ERVV-2B6SEH9 535 aa38.49■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SSFA2P28290 1259 aa38.48■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SULT6B1Q6IMI4 303 aa38.46■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GNPATO15228 680 aa38.45■■■■□ 3.75
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C1orf141Q5JVX7 400 aa38.43■■■■□ 3.74
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CD2APQ9Y5K6 639 aa38.42■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KDRP35968 1356 aa38.42■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CABP4P57796 275 aa38.41■■■■□ 3.74
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MTHFSP49914 203 aa38.4■■■■□ 3.74
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF831Q5JPB2 1677 aa38.35■■■■□ 3.73
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa38.3■■■■□ 3.72
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAPPC3LQ5T215 181 aa38.29■■■■□ 3.72
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa38.27■■■■□ 3.72
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCN11AQ9UI33 1791 aa38.26■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AKAP4Q5JQC9 854 aa38.25■■■■□ 3.71
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP38.23■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ADRA2BP18089 450 aa38.22■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP38.22■■■■□ 3.71
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPS6KA4O75676 772 aa38.21■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC52A2Q9HAB3 445 aa38.16■■■■□ 3.7
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PARP3Q9Y6F1 533 aa38.06■■■■□ 3.68
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATP10DQ9P241 1426 aa38.05■■■■□ 3.68
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UBR2Q8IWV8 1755 aa37.91■■■■□ 3.66
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GNAT3A8MTJ3 354 aa37.91■■■■□ 3.66
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TTC5Q8N0Z6 440 aa37.91■■■■□ 3.66
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TEFQ10587 303 aa37.9■■■■□ 3.66
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USPL1Q5W0Q7 1092 aa37.9■■■■□ 3.66
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IL17REQ8NFR9 667 aa37.87■■■■□ 3.65
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