RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567283.5

RPUSD1-209, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, human

TSL 3

Gene RPUSD1, Length 835 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD1-209	ENST00000567283	ITPK1	Q13572	414 aa		33.57	■■■□□ 2.96
RPUSD1-209	ENST00000567283	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
RPUSD1-209	ENST00000567283	ATG3	Q9NT62	314 aa		33.56	■■■□□ 2.96
RPUSD1-209	ENST00000567283	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
RPUSD1-209	ENST00000567283	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
RPUSD1-209	ENST00000567283	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.55	■■■□□ 2.96
RPUSD1-209	ENST00000567283	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RPUSD1-209	ENST00000567283	KDR	P35968	1356 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RPUSD1-209	ENST00000567283	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
RPUSD1-209	ENST00000567283	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RPUSD1-209	ENST00000567283	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		33.51	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	CABP4	P57796	275 aa		33.48	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	C1QTNF8	P60827	252 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		33.46	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.45	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
RPUSD1-209	ENST00000567283	MTHFS	P49914	203 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RPUSD1-209	ENST00000567283	MMP10	P09238	476 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RPUSD1-209	ENST00000567283	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RPUSD1-209	ENST00000567283	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RPUSD1-209	ENST00000567283	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
RPUSD1-209	ENST00000567283	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RPUSD1-209	ENST00000567283	C4A	P0C0L4	1744 aa		33.4	■■■□□ 2.94
RPUSD1-209	ENST00000567283	ATP10D	Q9P241	1426 aa		33.4	■■■□□ 2.94
RPUSD1-209	ENST00000567283	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.39	■■■□□ 2.94
RPUSD1-209	ENST00000567283	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		33.38	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	IL13	P35225	146 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	ADRA2B	P18089	450 aa		33.35	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	TJP1	Q07157	1748 aa		33.35	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	RFC4	P35249	363 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		33.33	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
RPUSD1-209	ENST00000567283	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		33.31	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	RPS6KA4	O75676	772 aa		33.31	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		33.31	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	HMOX1	P09601	288 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	ADCY9	O60503	1353 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	GYS1	P13807	737 aa		33.27	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		33.27	■■■□□ 2.92
RPUSD1-209	ENST00000567283	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		33.26	■■■□□ 2.91
RPUSD1-209	ENST00000567283	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
RPUSD1-209	ENST00000567283	MRC1	P22897	1456 aa		33.23	■■■□□ 2.91
RPUSD1-209	ENST00000567283	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		33.22	■■■□□ 2.91
RPUSD1-209	ENST00000567283	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
RPUSD1-209	ENST00000567283	TGFB2	P61812	414 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RPUSD1-209	ENST00000567283	BCS1L	Q9Y276	419 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RPUSD1-209	ENST00000567283		A0A0G2JLW4	131 aa		33.2	■■■□□ 2.91
RPUSD1-209	ENST00000567283	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
RPUSD1-209	ENST00000567283	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
RPUSD1-209	ENST00000567283	LGR6	Q9HBX8	967 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RPUSD1-209	ENST00000567283	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
RPUSD1-209	ENST00000567283	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
RPUSD1-209	ENST00000567283	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
RPUSD1-209	ENST00000567283	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RPUSD1-209	ENST00000567283	DPEP1	P16444	411 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RPUSD1-209	ENST00000567283	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RPUSD1-209	ENST00000567283	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		33.14	■■■□□ 2.9
RPUSD1-209	ENST00000567283	SLC39A6	Q13433	755 aa		33.14	■■■□□ 2.9
RPUSD1-209	ENST00000567283	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
RPUSD1-209	ENST00000567283	FCHSD2	O94868	740 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RPUSD1-209	ENST00000567283	FKBP8	Q14318	412 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RPUSD1-209	ENST00000567283	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
RPUSD1-209	ENST00000567283	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
RPUSD1-209	ENST00000567283	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
RPUSD1-209	ENST00000567283	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RPUSD1-209	ENST00000567283	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RPUSD1-209	ENST00000567283	CEP350	Q5VT06	3117 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RPUSD1-209	ENST00000567283	ZPR1	O75312	459 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RPUSD1-209	ENST00000567283	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RPUSD1-209	ENST00000567283	DDR1	Q08345	913 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RPUSD1-209	ENST00000567283	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.08	■■■□□ 2.89
RPUSD1-209	ENST00000567283	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
RPUSD1-209	ENST00000567283	COL15A1	P39059	1388 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RPUSD1-209	ENST00000567283	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
RPUSD1-209	ENST00000567283	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RPUSD1-209	ENST00000567283	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		33.05	■■■□□ 2.88
RPUSD1-209	ENST00000567283	PIM2	Q9P1W9	311 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RPUSD1-209	ENST00000567283	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RPUSD1-209	ENST00000567283	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88

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