RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 CPDO75976 1380 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 DCTN1Q14203 1278 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 PEAK1Q9H792 1746 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.31■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 LTN1O94822 1766 aa25.31■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 NRAPQ86VF7 1730 aa25.31■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLCN1P35523 988 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGPD5Q99666 1765 aa25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 COL18A1P39060 1754 aa25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-205ENST00000564630 STRN4Q9NRL3 753 aa25.25■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.25■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATRNO75882 1429 aa25.25■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRE11P49959 708 aa25.24■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDIT3P35638 169 aa25.24■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSCBQ8IWL3 235 aa25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHL1O00533 1208 aa25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 ILDR2Q71H61 639 aa25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRAK2O60296 914 aa25.2■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNX21Q969T3 373 aa25.2■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 EVA1CP58658 441 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGS12O14924 1447 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 MCM10Q7L590 875 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 GLI3P10071 1580 aa25.18■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 RXRBP28702 533 aa25.18■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 VPS72Q15906 364 aa25.18■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT24Q2M2I5 525 aa25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 AMPHP49418 695 aa25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 CRB1P82279 1406 aa25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.15■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 DCTPP1Q9H773 170 aa25.15■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCC6O95255 1503 aa25.14■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP10DQ9P241 1426 aa25.14■■□□□ 1.62
CCNDBP1-205ENST00000564630 HOXC9P31274 260 aa25.14■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTPRCP08575 1304 aa25.13■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTMSP20962 102 aa25.13■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 IP6K1Q92551 441 aa25.13■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF2CQ99661 725 aa25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 FLT4P35916 1363 aa25.11■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDC45O75419 566 aa25.1■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.1■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.1■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.1■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERBB3P21860 1342 aa25.1■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.1■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 PANK2Q9BZ23 570 aa25.09■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.09■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.09■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 RTL1A6NKG5 1358 aa25.09■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDRP35968 1356 aa25.09■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEP85Q6P2H3 762 aa25.08■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.07■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A0G2JS52 829 aa25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTC22Q5TAA0 569 aa25.05■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC4A2P04920 1241 aa25.05■■□□□ 1.6
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