RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 DCAF5Q96JK2 942 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 BTBD11A6QL63 1104 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 NRAPQ86VF7 1730 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRC1P22897 1456 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLIT2O94813 1529 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 DISP2A7MBM2 1401 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP35Q9P2H5 1018 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.69■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 AAMPQ13685 434 aa22.68■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOXB7P09629 217 aa22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.67■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNQ3O43525 872 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC4A2P04920 1241 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHDP01880 384 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 NECTIN2Q92692 538 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.64■■□□□ 1.22
USP3-AS1-208ENST00000560962 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSPA1LP34931 641 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCC4O15439 1325 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 SKAP1Q86WV1 359 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPRCP08575 1304 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 CABP4P57796 275 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF790Q6PG37 636 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 STK31Q9BXU1 1019 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRP6O75581 1613 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 G2E3Q7L622 706 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.6■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 C8orf37Q96NL8 207 aa22.6■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 NGLY1Q96IV0 654 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGS12O14924 1447 aa22.58■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 EXOC5O00471 708 aa22.58■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC39A6Q13433 755 aa22.58■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 BARGINQ6ZT62 677 aa22.58■■□□□ 1.21
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNS2Q63HR2 1409 aa22.58■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 CACNA1FO60840 1977 aa22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 VPS72Q15906 364 aa22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 FLIIQ13045 1269 aa22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 F6X3S4 739 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 PAPPAQ13219 1627 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDB1Q16531 1140 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP21Q9UK80 565 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 GLI3P10071 1580 aa22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 C5P01031 1676 aa22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-208ENST00000560962 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
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