RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF516	Q92618	1163 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	MET	P08581	1390 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	NWD1	Q149M9	1564 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	KCNA6	P17658	529 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	ADGRB1	O14514	1584 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	CPS1	P31327	1500 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	THAP11	Q96EK4	314 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	TECPR2	O15040	1411 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	ABCC11	Q96J66	1382 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	C6orf229	H3BNL8	230 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	PTCH1	Q13635	1447 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	IFFO2	Q5TF58	517 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	PTPRU	Q92729	1446 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	SPSB2	Q99619	263 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NUMB-231	ENST00000559312	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	TLL1	O43897	1013 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	ADH1B	P00325	375 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	MTMR2	Q13614	643 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	DLC1	Q96QB1	1528 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	RETREG3	Q86VR2	466 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	SIRT1	Q96EB6	747 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	LILRB3	O75022	631 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	QPCT	Q16769	361 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	MSS51	Q4VC12	460 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	STK26	Q9P289	416 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM94	Q12767	1356 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NUMB-231	ENST00000559312	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		10.58	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		10.58	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		10.58	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	PRAM1	Q96QH2	718 aa		10.58	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	DCC	P43146	1447 aa		10.57	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		10.57	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	PRR7	Q8TB68	274 aa		10.57	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	POGK	Q9P215	609 aa		10.57	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		10.56	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	GGCX	P38435	758 aa		10.56	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	10.56	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		10.56	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	10.56	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	MSH6	P52701	1360 aa		10.55	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	USP47	Q96K76	1375 aa		10.55	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	S1PR4	O95977	384 aa		10.55	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		10.55	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	C14orf37	Q86TY3	774 aa		10.55	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		10.55	□□□□□ -0.72
NUMB-231	ENST00000559312	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		10.55	□□□□□ -0.72

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