RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.8■■□□□ 1.56
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TSPAN3-204ENST00000558394 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.8■■□□□ 1.56
TSPAN3-204ENST00000558394 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.79■■□□□ 1.56
TSPAN3-204ENST00000558394 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TSPAN3-204ENST00000558394 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.56
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TSPAN3-204ENST00000558394 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.78■■□□□ 1.56
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TSPAN3-204ENST00000558394 ATG3Q9NT62 314 aa24.75■■□□□ 1.55
TSPAN3-204ENST00000558394 NCAPD2Q15021 1401 aa24.75■■□□□ 1.55
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TSPAN3-204ENST00000558394 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.74■■□□□ 1.55
TSPAN3-204ENST00000558394 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.73■■□□□ 1.55
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TSPAN3-204ENST00000558394 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.54■■□□□ 1.52
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TSPAN3-204ENST00000558394 TM4SF1P30408 202 aa24.44■■□□□ 1.5
TSPAN3-204ENST00000558394 RASSF7Q02833 373 aa24.44■■□□□ 1.5
TSPAN3-204ENST00000558394 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.44■■□□□ 1.5
TSPAN3-204ENST00000558394 PCNTO95613 3336 aa24.44■■□□□ 1.5
TSPAN3-204ENST00000558394 GLTPD2A6NH11 291 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN3-204ENST00000558394 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TSPAN3-204ENST00000558394 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TSPAN3-204ENST00000558394 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TSPAN3-204ENST00000558394 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN3-204ENST00000558394 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.39■■□□□ 1.5
TSPAN3-204ENST00000558394 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.39■■□□□ 1.49
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