RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 ITGB4P16144 1822 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 DCAF5Q96JK2 942 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 RNF181Q9P0P0 153 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 RTL1A6NKG5 1358 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 TMF1P82094 1093 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 COG3Q96JB2 828 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 C4AP0C0L4 1744 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 GYS1P13807 737 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-208ENST00000547298 ATP6V1AP38606 617 aa16.08■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 PIM2Q9P1W9 311 aa16.08■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.07■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.07■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.07■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 ATG3Q9NT62 314 aa16.07■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 SBF1O95248 1867 aa16.06■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 INSRP06213 1382 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 KDRP35968 1356 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 POTECB2RU33 542 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 FOXN1O15353 648 aa16.05■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.04■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 NCAPD2Q15021 1401 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 GLTPD2A6NH11 291 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 CHRNA5P30532 468 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 RASSF7Q02833 373 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 PARP3Q9Y6F1 533 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 ADRA2BP18089 450 aa16.02■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CS-208ENST00000547298 FYB1O15117 783 aa16.01■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 DDR1Q08345 913 aa16.01■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.01■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 RPS6KA4O75676 772 aa16■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 FAM161AQ3B820 660 aa16■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.99■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 RFC4P35249 363 aa15.99■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 FKBP8Q14318 412 aa15.98■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 CREBZFQ9NS37 354 aa15.98■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 FLT4P35916 1363 aa15.98■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 PHKG2P15735 406 aa15.97■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 LMNB1P20700 586 aa15.97■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.97■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 SPG7Q9UQ90 795 aa15.97■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.96■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 TESK2Q96S53 571 aa15.96■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.152e-6■■□□□ 11.9
CS-208ENST00000547298 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.96■□□□□ 0.15
CS-208ENST00000547298 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 TM4SF1P30408 202 aa15.95■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 CNTNAP1P78357 1384 aa15.95■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 TONSLQ96HA7 1378 aa15.95■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 POTEIP0CG38 1075 aa15.94■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 POTEJP0CG39 1038 aa15.94■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 IFNL2Q8IZJ0 200 aa15.93■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 ABHD8Q96I13 439 aa15.93■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.93■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 NFKBIEO00221 500 aa15.92■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 EYA1Q99502 592 aa15.92■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 WBP1LQ9NX94 342 aa15.92■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 LBX1P52954 281 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 CHADLQ6NUI6 762 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 TIAM2Q8IVF5 1701 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 VEGFBP49765 207 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 NEUROD1Q13562 356 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 PASKQ96RG2 1323 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-208ENST00000547298 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CS-208ENST00000547298 RGS19P49795 217 aa15.89■□□□□ 0.13
CS-208ENST00000547298 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-208ENST00000547298 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CS-208ENST00000547298 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CS-208ENST00000547298 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-208ENST00000547298 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CS-208ENST00000547298 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-208ENST00000547298 TTLL6Q8N841 843 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms