RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
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TRDN-205ENST00000546248 ACDQ96AP0 544 aa9.1□□□□□ -0.95
TRDN-205ENST00000546248 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TRDN-205ENST00000546248 MROH2BQ7Z745 1585 aa9.1□□□□□ -0.95
TRDN-205ENST00000546248 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TRDN-205ENST00000546248 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TRDN-205ENST00000546248 PHKA2P46019 1235 aa9.09□□□□□ -0.95
TRDN-205ENST00000546248 KANK3Q6NY19 840 aa9.09□□□□□ -0.95
TRDN-205ENST00000546248 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.09□□□□□ -0.95
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TRDN-205ENST00000546248 XAGE2Q96GT9 111 aa9.08□□□□□ -0.96
TRDN-205ENST00000546248 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
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TRDN-205ENST00000546248 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.07□□□□□ -0.96
TRDN-205ENST00000546248 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.06□□□□□ -0.96
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TRDN-205ENST00000546248 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.03□□□□□ -0.96
TRDN-205ENST00000546248 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.03□□□□□ -0.96
TRDN-205ENST00000546248 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.03□□□□□ -0.96
TRDN-205ENST00000546248 GNASQ5JWF2 1037 aa9.03□□□□□ -0.96
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TRDN-205ENST00000546248 RUBCNLQ9H714 662 aa9.03□□□□□ -0.96
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TRDN-205ENST00000546248 MSX1P28360 303 aa9.02□□□□□ -0.97
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TRDN-205ENST00000546248 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.02□□□□□ -0.97
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TRDN-205ENST00000546248 TLR1Q15399 786 aa9□□□□□ -0.97
TRDN-205ENST00000546248 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TRDN-205ENST00000546248 LRRC4BQ9NT99 713 aa9□□□□□ -0.97
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TRDN-205ENST00000546248 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.98□□□□□ -0.97
TRDN-205ENST00000546248 PHF24Q9UPV7 400 aa8.98□□□□□ -0.97
TRDN-205ENST00000546248 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.97□□□□□ -0.97
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TRDN-205ENST00000546248 WIZO95785 1651 aa8.96□□□□□ -0.98
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TRDN-205ENST00000546248 BNIP3LO60238 219 aa8.95□□□□□ -0.98
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TRDN-205ENST00000546248 SMARCA4P51532 1647 aa8.93□□□□□ -0.98
TRDN-205ENST00000546248 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.92□□□□□ -0.98
TRDN-205ENST00000546248 PIK3CDO00329 1044 aa8.92□□□□□ -0.98
TRDN-205ENST00000546248 BMP4P12644 408 aa8.92□□□□□ -0.98
TRDN-205ENST00000546248 FGFR3P22607 806 aa8.92□□□□□ -0.98
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