RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	GNRH1	P01148	92 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	BCR	P11274	1271 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXK2	Q01167	660 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	ACD	Q96AP0	544 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	F11	P03951	625 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	CNKSR1	Q969H4	720 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	IL2RA	P01589	272 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	MX2	P20592	715 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	CENPC	Q03188	943 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	THBS1	P07996	1170 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	XAGE2	Q96GT9	111 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	PODN	Q7Z5L7	613 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GTH6	734 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	OIP5	O43482	229 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	PHKA2	P46019	1235 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP2K3	P46734	347 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	DCAF5	Q96JK2	942 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	GPAM	Q9HCL2	828 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	PHF24	Q9UPV7	400 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	POM121C	A8CG34	1229 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	ABL2	P42684	1182 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	USP4	Q13107	963 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	KLRG1	Q96E93	195 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	MSTN	O14793	375 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGB2	P05107	769 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	MSX1	P28360	303 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	PGBD3	Q8N328	593 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	RUBCNL	Q9H714	662 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	IRF5	Q13568	498 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNHG1-222	ENST00000545308	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF135	Q8IUD6	432 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	TLR1	Q15399	786 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	EFHC2	Q5JST6	749 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	GLMN	Q92990	594 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	SIRT1	Q96EB6	747 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	PROC	P04070	461 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	RETREG2	Q8NC44	543 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNHG1-222	ENST00000545308	C2CD2L	O14523	706 aa		7.3	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms