RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542432.5

RECQL-208, Transcript of RecQ like helicase, human

TSL 3

Gene RECQL, Length 600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RECQL-208	ENST00000542432	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	CABP4	P57796	275 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	GNPAT	O15228	680 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	KDR	P35968	1356 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	GPR162	Q16538	588 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	SSFA2	P28290	1259 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RECQL-208	ENST00000542432	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	MMP10	P09238	476 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RECQL-208	ENST00000542432	RPS6KA4	O75676	772 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	PPP2R1A	P30153	589 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	RFC4	P35249	363 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	GYS1	P13807	737 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	TJP1	Q07157	1748 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	MRC1	P22897	1456 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	ADRA2B	P18089	450 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	GRIN3B	O60391	1043 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	FKBP8	Q14318	412 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432	C4A	P0C0L4	1744 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RECQL-208	ENST00000542432		A0A0G2JLW4	131 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	TEF	Q10587	303 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	CHD4	Q14839	1912 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	KCNQ3	O43525	872 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	DDR1	Q08345	913 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	MCM10	Q7L590	875 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	COL15A1	P39059	1388 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	ZPR1	O75312	459 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	DPEP1	P16444	411 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	BCS1L	Q9Y276	419 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RECQL-208	ENST00000542432	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25

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