RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538734.6

MIR9-3HG-202, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 2

Gene MIR9-3HG, Length 1,877 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.15■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TNNQ9UQP3 1299 aa26.15■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.13■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.13■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DISP2A7MBM2 1401 aa26.13■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KCNQ3O43525 872 aa26.13■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MS4A1P11836 297 aa26.13■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TRIM27P14373 513 aa26.13■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.13■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RLBP1P12271 317 aa26.12■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.12■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.11■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.11■■□□□ 1.77
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 NGLY1Q96IV0 654 aa26.11■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 C8orf37Q96NL8 207 aa26.11■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 COG6Q9Y2V7 657 aa26.11■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.1■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MRC1P22897 1456 aa26.09■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.08■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.08■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.08■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LRP6O75581 1613 aa26.07■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CABP4P57796 275 aa26.07■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.06■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.06■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.05■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EXOC5O00471 708 aa26.05■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SLC4A2P04920 1241 aa26.05■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HOXB7P09629 217 aa26.05■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.05■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF790Q6PG37 636 aa26.05■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.05■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SLC39A6Q13433 755 aa26.03■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BARGINQ6ZT62 677 aa26.02■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 STK31Q9BXU1 1019 aa26.02■■□□□ 1.76
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 VPS72Q15906 364 aa26.01■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.01■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.01■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 PTPRCP08575 1304 aa25.99■■□□□ 1.75
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 USP21Q9UK80 565 aa25.98■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TNS2Q63HR2 1409 aa25.98■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 G2E3Q7L622 706 aa25.98■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ABCC4O15439 1325 aa25.97■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DDB1Q16531 1140 aa25.97■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.97■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.96■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.96■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.95■■□□□ 1.75
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.94■■□□□ 1.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RGS12O14924 1447 aa25.94■■□□□ 1.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.94■■□□□ 1.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FLIIQ13045 1269 aa25.92■■□□□ 1.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.92■■□□□ 1.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.91■■□□□ 1.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ITGB4P16144 1822 aa25.89■■□□□ 1.74
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PIGBQ92521 554 aa25.89■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PAPPAQ13219 1627 aa25.89■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AFF2P51816 1311 aa25.89■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 C5P01031 1676 aa25.88■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.87■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.87■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.87■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 USP16Q9Y5T5 823 aa25.86■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 F6X3S4 739 aa25.85■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.85■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ANXA1P04083 346 aa25.85■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.85■■□□□ 1.73
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.85■■□□□ 1.73
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