RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	ABCC2	Q92887	1545 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	ARID3C	A6NKF2	412 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CFAP44	Q96MT7	982 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CEP89	Q96ST8	783 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		9.34	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		9.33	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CHD1	O14646	1710 aa		9.33	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		9.33	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ACTN2	P35609	894 aa		9.33	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		9.33	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	IVL	P07476	585 aa		9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	USP27X	A6NNY8	438 aa		9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CLSTN1	O94985	981 aa		9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ROCK1	Q13464	1354 aa		9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	TMF1	P82094	1093 aa		9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	TRDN	Q13061	729 aa		9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	IQUB	Q8NA54	791 aa		9.32	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		9.31	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	MAP9	Q49MG5	647 aa		9.31	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		9.31	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		9.31	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		9.31	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		9.31	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	SCP2	P22307	547 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	MNAT1	P51948	309 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	EXOC4	Q96A65	974 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	TESK2	Q96S53	571 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	FBXO3	Q9UK99	471 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	PIK3C2G	O75747	1445 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351		H0YHG0	523 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	TRIM27	P14373	513 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	JMY	Q8N9B5	988 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	NBPF11	Q86T75	865 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	TRIM5	Q9C035	493 aa		9.3	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CORO7	P57737	925 aa		9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	TMX3	Q96JJ7	454 aa		9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	DAPK1	P53355	1430 aa		9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	KIF3C	O14782	793 aa		9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	TPM1	P09493	284 aa		9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC192	P0DO97	292 aa		9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	LUZP1	Q86V48	1076 aa		9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	9.29	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	SMC2	O95347	1197 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	KANK1	Q14678	1352 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	UBE2H	P62256	183 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	UBXN4	Q92575	508 aa		9.28	□□□□□ -0.92
ZNF438-208	ENST00000538351	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		9.28	□□□□□ -0.92

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