RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, humanhuman

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3-204ENST00000534967 MMP10P09238 476 aa36.44■■■■□ 3.42
GOLGA3-204ENST00000534967 POLR3GLQ9BT43 218 aa36.43■■■■□ 3.42
GOLGA3-204ENST00000534967 KDRP35968 1356 aa36.4■■■■□ 3.42
GOLGA3-204ENST00000534967 HSPA6P17066 643 aa36.39■■■■□ 3.42
GOLGA3-204ENST00000534967 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
GOLGA3-204ENST00000534967 SLC4A9Q96Q91 983 aa36.38■■■■□ 3.41
GOLGA3-204ENST00000534967 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
GOLGA3-204ENST00000534967 PXDNLA1KZ92 1463 aa36.37■■■■□ 3.41
GOLGA3-204ENST00000534967 TRAPPC3LQ5T215 181 aa36.37■■■■□ 3.41
GOLGA3-204ENST00000534967 IFFO2Q5TF58 517 aa36.37■■■■□ 3.41
GOLGA3-204ENST00000534967 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
GOLGA3-204ENST00000534967 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
GOLGA3-204ENST00000534967 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa36.35■■■■□ 3.41
GOLGA3-204ENST00000534967 KIF13BQ9NQT8 1826 aa36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3-204ENST00000534967 ERVV-2B6SEH9 535 aa36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3-204ENST00000534967 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa36.34■■■■□ 3.41
GOLGA3-204ENST00000534967 KIF3CO14782 793 aa36.32■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 NLGN1Q8N2Q7 840 aa36.32■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 DCAF5Q96JK2 942 aa36.32■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.31■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 ZNF831Q5JPB2 1677 aa36.3■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 A0A0G2JLW4 131 aa36.3■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 TGFB2P61812 414 aa36.3■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 BCS1LQ9Y276 419 aa36.3■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 C10orf71Q711Q0 1435 aa36.29■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa36.28■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 ADRA2BP18089 450 aa36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 GYS1P13807 737 aa36.26■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 CABP4P57796 275 aa36.26■■■■□ 3.4
GOLGA3-204ENST00000534967 RPS6KA4O75676 772 aa36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3-204ENST00000534967 RFC4P35249 363 aa36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3-204ENST00000534967 CCDC87Q9NVE4 849 aa36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3-204ENST00000534967 C4AP0C0L4 1744 aa36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3-204ENST00000534967 DPEP1P16444 411 aa36.23■■■■□ 3.39
GOLGA3-204ENST00000534967 AMOTQ4VCS5 1084 aa36.22■■■■□ 3.39
GOLGA3-204ENST00000534967 PANK3Q9H999 370 aa36.22■■■■□ 3.39
GOLGA3-204ENST00000534967 PARP3Q9Y6F1 533 aa36.22■■■■□ 3.39
GOLGA3-204ENST00000534967 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa36.21■■■■□ 3.39
GOLGA3-204ENST00000534967 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
GOLGA3-204ENST00000534967 AEBP1Q8IUX7 1158 aa36.21■■■■□ 3.39
GOLGA3-204ENST00000534967 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
GOLGA3-204ENST00000534967 MTHFSP49914 203 aa36.19■■■■□ 3.38
GOLGA3-204ENST00000534967 FCHSD2O94868 740 aa36.18■■■■□ 3.38
GOLGA3-204ENST00000534967 C1orf141Q5JVX7 400 aa36.16■■■■□ 3.38
GOLGA3-204ENST00000534967 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
GOLGA3-204ENST00000534967 CRKLP46109 303 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
GOLGA3-204ENST00000534967 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa36.14■■■■□ 3.38
GOLGA3-204ENST00000534967 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
GOLGA3-204ENST00000534967 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 KCNA3P22001 575 aa36.13■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.12■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 MORC1Q86VD1 984 aa36.12■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 TOMM70O94826 608 aa36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 SULT6B1Q6IMI4 303 aa36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 NMRK2Q9NPI5 230 aa36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 APLP1P51693 650 aa36.09■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 FKBP8Q14318 412 aa36.09■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.08■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 TJP1Q07157 1748 aa36.08■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.08■■■■□ 3.37
GOLGA3-204ENST00000534967 DDR1Q08345 913 aa36.07■■■■□ 3.36
GOLGA3-204ENST00000534967 C9orf131Q5VYM1 1079 aa36.07■■■■□ 3.36
GOLGA3-204ENST00000534967 PIM2Q9P1W9 311 aa36.07■■■■□ 3.36
GOLGA3-204ENST00000534967 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa36.06■■■■□ 3.36
GOLGA3-204ENST00000534967 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
GOLGA3-204ENST00000534967 SCN11AQ9UI33 1791 aa36.02■■■■□ 3.36
GOLGA3-204ENST00000534967 IL13P35225 146 aa36.02■■■■□ 3.36
GOLGA3-204ENST00000534967 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
GOLGA3-204ENST00000534967 CHRNA5P30532 468 aa36■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 DNAJC10Q8IXB1 793 aa35.99■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa35.98■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa35.98■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 AKAP4Q5JQC9 854 aa35.97■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 KNSTRNQ9Y448 316 aa35.97■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 TM4SF1P30408 202 aa35.96■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 USPL1Q5W0Q7 1092 aa35.95■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 SLC52A2Q9HAB3 445 aa35.95■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 LGR6Q9HBX8 967 aa35.95■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 RNF181Q9P0P0 153 aa35.95■■■■□ 3.35
GOLGA3-204ENST00000534967 KCPQ6ZWJ8 1503 aa35.94■■■■□ 3.34
GOLGA3-204ENST00000534967 ZPR1O75312 459 aa35.94■■■■□ 3.34
GOLGA3-204ENST00000534967 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
GOLGA3-204ENST00000534967 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
GOLGA3-204ENST00000534967 SLC39A6Q13433 755 aa35.91■■■■□ 3.34
GOLGA3-204ENST00000534967 KDM2BQ8NHM5 1336 aa35.9■■■■□ 3.34
GOLGA3-204ENST00000534967 WDR90Q96KV7 1748 aa35.89■■■■□ 3.34
GOLGA3-204ENST00000534967 RNMTO43148 476 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
GOLGA3-204ENST00000534967 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
GOLGA3-204ENST00000534967 MRC1P22897 1456 aa35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms