RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, human

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRJ-206	ENST00000534219	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PTPRJ-206	ENST00000534219	HMOX1	P09601	288 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PTPRJ-206	ENST00000534219	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PTPRJ-206	ENST00000534219	ITPK1	Q13572	414 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PTPRJ-206	ENST00000534219	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PTPRJ-206	ENST00000534219	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
PTPRJ-206	ENST00000534219	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
PTPRJ-206	ENST00000534219	C4B	P0C0L5	1744 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PTPRJ-206	ENST00000534219	SMIM5	Q71RC9	77 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PTPRJ-206	ENST00000534219	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PTPRJ-206	ENST00000534219	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.99
PTPRJ-206	ENST00000534219	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PTPRJ-206	ENST00000534219	GNPAT	O15228	680 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PTPRJ-206	ENST00000534219	SSFA2	P28290	1259 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PTPRJ-206	ENST00000534219	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PTPRJ-206	ENST00000534219	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PTPRJ-206	ENST00000534219	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
PTPRJ-206	ENST00000534219	GPR162	Q16538	588 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PTPRJ-206	ENST00000534219	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PTPRJ-206	ENST00000534219	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	33.63	■■■□□ 2.97
PTPRJ-206	ENST00000534219	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PTPRJ-206	ENST00000534219	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
PTPRJ-206	ENST00000534219	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
PTPRJ-206	ENST00000534219	LGR6	Q9HBX8	967 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PTPRJ-206	ENST00000534219	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
PTPRJ-206	ENST00000534219	UTRN	P46939	3433 aa		33.57	■■■□□ 2.97
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PTPRJ-206	ENST00000534219	CFAP53	Q96M91	514 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PTPRJ-206	ENST00000534219	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PTPRJ-206	ENST00000534219	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PTPRJ-206	ENST00000534219	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
PTPRJ-206	ENST00000534219	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
PTPRJ-206	ENST00000534219	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PTPRJ-206	ENST00000534219	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PTPRJ-206	ENST00000534219	RPS6KA4	O75676	772 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PTPRJ-206	ENST00000534219	ADRA2B	P18089	450 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPP2R1A	P30153	589 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PTPRJ-206	ENST00000534219	RFC4	P35249	363 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PTPRJ-206	ENST00000534219	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC39A6	Q13433	755 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PTPRJ-206	ENST00000534219	NUDC	Q9Y266	331 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PTPRJ-206	ENST00000534219	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PTPRJ-206	ENST00000534219	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PTPRJ-206	ENST00000534219	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
PTPRJ-206	ENST00000534219	MMP10	P09238	476 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	MRC1	P22897	1456 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	GRIN3B	O60391	1043 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	33.41	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	PRKAR2B	P31323	418 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	33.41	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	GYS1	P13807	737 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	TEF	Q10587	303 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PTPRJ-206	ENST00000534219	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	CHD4	Q14839	1912 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	TJP1	Q07157	1748 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PTPRJ-206	ENST00000534219	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PTPRJ-206	ENST00000534219	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PTPRJ-206	ENST00000534219	FCHSD2	O94868	740 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PTPRJ-206	ENST00000534219	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PTPRJ-206	ENST00000534219	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
PTPRJ-206	ENST00000534219	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZPR1	O75312	459 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF790	Q6PG37	636 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PTPRJ-206	ENST00000534219	FKBP8	Q14318	412 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PTPRJ-206	ENST00000534219	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
PTPRJ-206	ENST00000534219	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	STARD3NL	O95772	234 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	TGFB2	P61812	414 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	BTBD11	A6QL63	1104 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	C4A	P0C0L4	1744 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219		A0A0G2JLW4	131 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	MCM10	Q7L590	875 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PTPRJ-206	ENST00000534219	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91

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