RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533903.1

ZBED5-208, Transcript of zinc finger BED-type containing 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZBED5, Length 3,214 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5-208ENST00000533903 ERBB3P21860 1342 aa8.67□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 C8orf37Q96NL8 207 aa8.67□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.67□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 CRB1P82279 1406 aa8.66□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.66□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 BTG4Q9NY30 223 aa8.66□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 USP21Q9UK80 565 aa8.66□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 SOX12O15370 315 aa8.66□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.66□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 PLCH1Q4KWH8 1693 aa8.65□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.65□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.65□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 AFF2P51816 1311 aa8.65□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.65□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.65□□□□□ -1.02
ZBED5-208ENST00000533903 NEFMP07197 916 aa8.65□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 BARGINQ6ZT62 677 aa8.65□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 ATRNO75882 1429 aa8.65□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 NCAPD2Q15021 1401 aa8.65□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 CHRNA2Q15822 529 aa8.64□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.64□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 IL13P35225 146 aa8.64□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa8.64□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 NRAPQ86VF7 1730 aa8.64□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.64□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.64□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 FCHSD2O94868 740 aa8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 NGEFQ8N5V2 710 aa8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 PEAK1Q9H792 1746 aa8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.63□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.62□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 KDM2BQ8NHM5 1336 aa8.62□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 KDRP35968 1356 aa8.62□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.62□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.62□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 CARNS1A5YM72 827 aa8.61□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.61□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 SGSM3Q96HU1 749 aa8.61□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 STRN4Q9NRL3 753 aa8.61□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 GPATCH11Q8N954 259 aa8.61□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 EYA1Q99502 592 aa8.61□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 FAM117AQ9C073 453 aa8.61□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 IL2RBP14784 551 aa8.6□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 PTMSP20962 102 aa8.6□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 RXRBP28702 533 aa8.6□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 SPG7Q9UQ90 795 aa8.6□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 RGPD1P0DJD0 1748 aa8.6□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 FBLN1P23142 703 aa8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 FOSBP53539 338 aa8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 NFKBIBQ15653 356 aa8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 SEMA3EO15041 775 aa8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 NBPF4Q96M43 638 aa8.59□□□□□ -1.03
ZBED5-208ENST00000533903 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ZBED5-208ENST00000533903 DISP2A7MBM2 1401 aa8.58□□□□□ -1.04
ZBED5-208ENST00000533903 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ZBED5-208ENST00000533903 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.58□□□□□ -1.04
ZBED5-208ENST00000533903 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.58□□□□□ -1.04
ZBED5-208ENST00000533903 RGPD5Q99666 1765 aa8.58□□□□□ -1.04
ZBED5-208ENST00000533903 EXOC5O00471 708 aa8.58□□□□□ -1.04
ZBED5-208ENST00000533903 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ZBED5-208ENST00000533903 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.58□□□□□ -1.04
ZBED5-208ENST00000533903 PROM2Q8N271 834 aa8.58□□□□□ -1.04
ZBED5-208ENST00000533903 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ZBED5-208ENST00000533903 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.57□□□□□ -1.04
ZBED5-208ENST00000533903 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms