RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532316.1

PKNOX2-AS1-201, Transcript of PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PKNOX2-AS1, Length 586 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ATP6V1AP38606 617 aa32.04■■■□□ 2.72
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SSFA2P28290 1259 aa32.02■■■□□ 2.72
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 AKAP4Q5JQC9 854 aa32.02■■■□□ 2.72
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LINC00116Q8NCU8 138 aa32.01■■■□□ 2.71
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HMOX1P09601 288 aa31.99■■■□□ 2.71
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF831Q5JPB2 1677 aa31.99■■■□□ 2.71
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ITPK1Q13572 414 aa31.98■■■□□ 2.71
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CFAP53Q96M91 514 aa31.96■■■□□ 2.71
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PHF14O94880 888 aa31.95■■■□□ 2.71
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 YY1P25490 414 aa31.95■■■□□ 2.71
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KLHL34Q8N239 644 aa31.95■■■□□ 2.71
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 UBR3Q6ZT12 1888 aa31.95■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GNPATO15228 680 aa31.94■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa31.94■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MSL1Q68DK7 614 aa31.93■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SCN11AQ9UI33 1791 aa31.9■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 AMIGO3Q86WK7 504 aa31.9■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SLC52A2Q9HAB3 445 aa31.9■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SLC4A9Q96Q91 983 aa31.89■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa31.89■■■□□ 2.7
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ADRA2BP18089 450 aa31.88■■■□□ 2.69
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MRC1P22897 1456 aa31.87■■■□□ 2.69
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RNMTO43148 476 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NUDCQ9Y266 331 aa31.87■■■□□ 2.69
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CD2APQ9Y5K6 639 aa31.86■■■□□ 2.69
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GPR162Q16538 588 aa31.85■■■□□ 2.69
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRAPPC3LQ5T215 181 aa31.85■■■□□ 2.69
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GAS2L2Q8NHY3 880 aa31.85■■■□□ 2.69
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LGR6Q9HBX8 967 aa31.84■■■□□ 2.69
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RPS6KA4O75676 772 aa31.82■■■□□ 2.68
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PPP2R1AP30153 589 aa31.82■■■□□ 2.68
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa31.81■■■□□ 2.68
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SMIM5Q71RC9 77 aa31.81■■■□□ 2.68
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NLGN2Q8NFZ4 835 aa31.81■■■□□ 2.68
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NLGN1Q8N2Q7 840 aa31.78■■■□□ 2.68
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GNAT3A8MTJ3 354 aa31.77■■■□□ 2.68
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RFC4P35249 363 aa31.77■■■□□ 2.68
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CRKLP46109 303 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PRKAR2BP31323 418 aa31.74■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RSPH6AQ9H0K4 717 aa31.74■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GRIN3BO60391 1043 aa31.73■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TEFQ10587 303 aa31.73■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 VSIG10Q8N0Z9 540 aa31.73■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TJP1Q07157 1748 aa31.72■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FCHSD2O94868 740 aa31.71■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MMP10P09238 476 aa31.71■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SLC39A6Q13433 755 aa31.71■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TTC5Q8N0Z6 440 aa31.71■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 UTRNP46939 3433 aa31.71■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DNAJC10Q8IXB1 793 aa31.69■■■□□ 2.66
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC87Q9NVE4 849 aa31.69■■■□□ 2.66
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KCPQ6ZWJ8 1503 aa31.69■■■□□ 2.66
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GYS1P13807 737 aa31.68■■■□□ 2.66
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CHD4Q14839 1912 aa31.68■■■□□ 2.66
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IL17REQ8NFR9 667 aa31.67■■■□□ 2.66
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PHACTR3Q96KR7 559 aa31.66■■■□□ 2.66
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa31.66■■■□□ 2.66
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 C4AP0C0L4 1744 aa31.63■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP31.63■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PARP3Q9Y6F1 533 aa31.63■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF790Q6PG37 636 aa31.62■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 UBR2Q8IWV8 1755 aa31.62■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 STARD3NLO95772 234 aa31.61■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NEFMP07197 916 aa31.61■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZPR1O75312 459 aa31.6■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TGFB2P61812 414 aa31.59■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HEG1Q9ULI3 1381 aa31.57■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RALBP1Q15311 655 aa31.57■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FMNL2Q96PY5 1086 aa31.57■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 C10orf71Q711Q0 1435 aa31.57■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 COL15A1P39059 1388 aa31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.4 ms