RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 SCN11AQ9UI33 1791 aa29.48■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 STK31Q9BXU1 1019 aa29.48■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.47■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 CACNA1FO60840 1977 aa29.47■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 HOXB7P09629 217 aa29.46■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 CYP27B1O15528 508 aa29.44■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 EVA1CP58658 441 aa29.44■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 STRN4Q9NRL3 753 aa29.44■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 PHLPP1O60346 1717 aa29.43■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 KCNQ3O43525 872 aa29.43■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 TOM1O60784 492 aa29.43■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 SKAP1Q86WV1 359 aa29.42■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa29.41■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 G2E3Q7L622 706 aa29.41■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 DCAF5Q96JK2 942 aa29.41■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.41■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 SLC52A2Q9HAB3 445 aa29.41■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 MRC1P22897 1456 aa29.4■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 IL2RBP14784 551 aa29.39■■■□□ 2.3
ACER3-204ENST00000525861 NECTIN2Q92692 538 aa29.38■■■□□ 2.29
ACER3-204ENST00000525861 BTG4Q9NY30 223 aa29.38■■■□□ 2.29
ACER3-204ENST00000525861 HEG1Q9ULI3 1381 aa29.38■■■□□ 2.29
ACER3-204ENST00000525861 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.38■■■□□ 2.29
ACER3-204ENST00000525861 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.38■■■□□ 2.29
ACER3-204ENST00000525861 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
ACER3-204ENST00000525861 FLIIQ13045 1269 aa29.37■■■□□ 2.29
ACER3-204ENST00000525861 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa29.33■■■□□ 2.29
ACER3-204ENST00000525861 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
ACER3-204ENST00000525861 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
ACER3-204ENST00000525861 PIP4K2BP78356 416 aa29.33■■■□□ 2.29
ACER3-204ENST00000525861 ZNF790Q6PG37 636 aa29.32■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.31■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 CCT4P50991 539 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 F6X3S4 739 aa29.3■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 RGS3P49796 1198 aa29.3■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 C1orf115Q9H7X2 142 aa29.29■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 CHPF2Q9P2E5 772 aa29.29■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 SLC39A6Q13433 755 aa29.28■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.27■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 SMC5Q8IY18 1101 aa29.27■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.27■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 PXDNLA1KZ92 1463 aa29.27■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 CABP4P57796 275 aa29.27■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 USP35Q9P2H5 1018 aa29.27■■■□□ 2.28
ACER3-204ENST00000525861 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.26■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.25■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 ERVV-2B6SEH9 535 aa29.24■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 PDE4AP27815 886 aa29.24■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 DISP2A7MBM2 1401 aa29.23■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 TTC5Q8N0Z6 440 aa29.23■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa29.22■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 MEIS3Q99687 375 aa29.22■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 ADAMTS2O95450 1211 aa29.21■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 SIRT2Q8IXJ6 389 aa29.21■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 BACH2Q9BYV9 841 aa29.21■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 C5P01031 1676 aa29.21■■■□□ 2.27
ACER3-204ENST00000525861 ATP10DQ9P241 1426 aa29.2■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 NRAPQ86VF7 1730 aa29.19■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 GCC1Q96CN9 775 aa29.18■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 FMNL2Q96PY5 1086 aa29.18■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 ANXA1P04083 346 aa29.17■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.16■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 HYPKQ9NX55 129 aa29.16■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.16■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.16■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 PROSER3Q2NL68 480 aa29.15■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 GLI3P10071 1580 aa29.14■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 CEP85Q6P2H3 762 aa29.14■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.14■■■□□ 2.26
ACER3-204ENST00000525861 NUCB1Q02818 461 aa29.14■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 PAPPAQ13219 1627 aa29.13■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 PI4KAP2A4QPH2 592 aa29.13■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 GNAI3P08754 354 aa29.13■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 FAM161AQ3B820 660 aa29.13■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa29.13■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 DNAAF4Q8WXU2 420 aa29.13■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.13■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 UBR2Q8IWV8 1755 aa29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms