RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520063.1

TMPRSS4-209, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 3

Gene TMPRSS4, Length 354 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-209ENST00000520063 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.69■■□□□ 1.06
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TMPRSS4-209ENST00000520063 CABP4P57796 275 aa21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4-209ENST00000520063 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4-209ENST00000520063 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4-209ENST00000520063 ATP6V1AP38606 617 aa21.67■■□□□ 1.06
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TMPRSS4-209ENST00000520063 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.66■■□□□ 1.06
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TMPRSS4-209ENST00000520063 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.63■■□□□ 1.05
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TMPRSS4-209ENST00000520063 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
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TMPRSS4-209ENST00000520063 UTRNP46939 3433 aa21.6■■□□□ 1.05
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TMPRSS4-209ENST00000520063 YY1P25490 414 aa21.59■■□□□ 1.05
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TMPRSS4-209ENST00000520063 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS4-209ENST00000520063 PPP2R1AP30153 589 aa21.57■■□□□ 1.04
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TMPRSS4-209ENST00000520063 RPS6KA4O75676 772 aa21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 SMIM5Q71RC9 77 aa21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 NUDCQ9Y266 331 aa21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 TJP1Q07157 1748 aa21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 KLHL34Q8N239 644 aa21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4-209ENST00000520063 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.51■■□□□ 1.03
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TMPRSS4-209ENST00000520063 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4-209ENST00000520063 GPR162Q16538 588 aa21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4-209ENST00000520063 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4-209ENST00000520063 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.5■■□□□ 1.03
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TMPRSS4-209ENST00000520063 FCHSD2O94868 740 aa21.48■■□□□ 1.03
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TMPRSS4-209ENST00000520063 IL17REQ8NFR9 667 aa21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4-209ENST00000520063 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.47■■□□□ 1.03
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TMPRSS4-209ENST00000520063 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS4-209ENST00000520063 CHD4Q14839 1912 aa21.47■■□□□ 1.03
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TMPRSS4-209ENST00000520063 SLC39A6Q13433 755 aa21.46■■□□□ 1.03
TMPRSS4-209ENST00000520063 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.46■■□□□ 1.03
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TMPRSS4-209ENST00000520063 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS4-209ENST00000520063 C4AP0C0L4 1744 aa21.45■■□□□ 1.02
TMPRSS4-209ENST00000520063 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS4-209ENST00000520063 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS4-209ENST00000520063 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS4-209ENST00000520063 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TMPRSS4-209ENST00000520063 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS4-209ENST00000520063 TEFQ10587 303 aa21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS4-209ENST00000520063 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TMPRSS4-209ENST00000520063 ZNF790Q6PG37 636 aa21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS4-209ENST00000520063 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.42■■□□□ 1.02
TMPRSS4-209ENST00000520063 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.42■■□□□ 1.02
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TMPRSS4-209ENST00000520063 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
TMPRSS4-209ENST00000520063 STARD3NLO95772 234 aa21.38■■□□□ 1.01
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TMPRSS4-209ENST00000520063 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
TMPRSS4-209ENST00000520063 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.38■■□□□ 1.01
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TMPRSS4-209ENST00000520063 COL15A1P39059 1388 aa21.36■■□□□ 1.01
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